More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3800 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3800  sodium ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
262 aa  525  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  hitchhiker  0.00685635 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  54.3 
 
 
248 aa  271  5.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  53.6 
 
 
248 aa  261  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  51.95 
 
 
248 aa  255  6e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  51.95 
 
 
248 aa  255  6e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  51.19 
 
 
244 aa  244  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  50.6 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  48.83 
 
 
251 aa  243  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  49 
 
 
244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  51.74 
 
 
244 aa  238  9e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  50 
 
 
244 aa  233  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  48.05 
 
 
244 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  48.05 
 
 
244 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  50.85 
 
 
244 aa  232  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  48.64 
 
 
244 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  48.64 
 
 
244 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  48.05 
 
 
244 aa  231  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  48.64 
 
 
244 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  48.25 
 
 
244 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  48.64 
 
 
244 aa  229  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  50 
 
 
244 aa  228  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  52.21 
 
 
244 aa  228  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  41.53 
 
 
273 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  42.19 
 
 
260 aa  195  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  41.07 
 
 
243 aa  195  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  41.52 
 
 
243 aa  195  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  38.96 
 
 
241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  38.89 
 
 
251 aa  189  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  38.61 
 
 
274 aa  185  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1528  ABC transporter related  46.96 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0114  ABC transporter related  37.3 
 
 
258 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3195  ABC transporter related protein  40.84 
 
 
285 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0768  ABC transporter related protein  38.8 
 
 
255 aa  170  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  41.23 
 
 
332 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 
356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1675  ABC transporter related  40.79 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  42.67 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.4 
 
 
249 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  37.68 
 
 
310 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  39.6 
 
 
259 aa  158  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3024  ABC transporter related  39.26 
 
 
338 aa  157  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851155  normal  0.0538989 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  37.66 
 
 
303 aa  158  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.33 
 
 
334 aa  157  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  36.44 
 
 
328 aa  157  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3736  Na+ extrusion transport system ATP-binding protein  39.08 
 
 
249 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  34.98 
 
 
293 aa  156  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  34.63 
 
 
305 aa  155  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2751  ABC transporter related  37.98 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  39.61 
 
 
314 aa  155  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.03 
 
 
312 aa  155  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  36.55 
 
 
240 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  34.2 
 
 
303 aa  155  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.86 
 
 
321 aa  155  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0872  ABC transporter related  40.18 
 
 
229 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0610304 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1130  ABC transporter related  38.61 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  hitchhiker  0.000478037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  40.93 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  42.03 
 
 
314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.63 
 
 
312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  34.58 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  38.43 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.47 
 
 
331 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  33.61 
 
 
253 aa  152  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  34.58 
 
 
331 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  34.58 
 
 
303 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  40.99 
 
 
1010 aa  152  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.65 
 
 
324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  41.96 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  35.47 
 
 
303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 
331 aa  151  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  38.22 
 
 
300 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  33.73 
 
 
257 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  40.97 
 
 
253 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  36.16 
 
 
236 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  39.55 
 
 
340 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  38.39 
 
 
304 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  34.98 
 
 
303 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
252 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.59 
 
 
305 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  41.23 
 
 
320 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  34.58 
 
 
308 aa  150  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  41.71 
 
 
326 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  38.4 
 
 
242 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  35.74 
 
 
334 aa  150  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  34.51 
 
 
303 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.37 
 
 
330 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  34.67 
 
 
252 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1791  ABC transporter-like protein  36.36 
 
 
240 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.89 
 
 
316 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  39.42 
 
 
318 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  41.71 
 
 
304 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  39.24 
 
 
252 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  40.48 
 
 
337 aa  149  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  41.98 
 
 
314 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  36.57 
 
 
325 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  34.7 
 
 
327 aa  149  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
241 aa  149  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  35.84 
 
 
617 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  37.07 
 
 
299 aa  149  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.59 
 
 
305 aa  149  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  37.5 
 
 
593 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>