138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2199 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2199  2-selenouridine synthase  100 
 
 		 281 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3666  tRNA 2-selenouridine synthase  64.64 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3480  tRNA 2-selenouridine synthase  58.93 
 
 		 373 aa  333  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2803  tRNA 2-selenouridine synthase  58.93 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1349  tRNA 2-selenouridine synthase  58.63 
 
 		 356 aa  332  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3859  tRNA 2-selenouridine synthase  60.07 
 
 		 353 aa  328  9e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2244  tRNA 2-selenouridine synthase  57.14 
 
 		 350 aa  316  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.590434  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2715  tRNA 2-selenouridine synthase  53.41 
 
 		 353 aa  298  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370816 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1757  tRNA 2-selenouridine synthase  49.28 
 
 		 346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1508  tRNA 2-selenouridine synthase  51.18 
 
 		 375 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4730  tRNA 2-selenouridine synthase  50.39 
 
 		 375 aa  254  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.913097  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1488  tRNA 2-selenouridine synthase  50 
 
 		 375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3699  tRNA 2-selenouridine synthase  47.86 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.919346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6564  tRNA 2-selenouridine synthase  49.61 
 
 		 355 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0745888  hitchhiker  0.00486619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1569  tRNA 2-selenouridine synthase  50.79 
 
 		 375 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.866156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0932  tRNA 2-selenouridine synthase  49.62 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0620  tRNA 2-selenouridine synthase  49.62 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1112  tRNA 2-selenouridine synthase  50.79 
 
 		 375 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1592  tRNA 2-selenouridine synthase  50.79 
 
 		 375 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0414382  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0765  tRNA 2-selenouridine synthase  49.62 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0754  tRNA 2-selenouridine synthase  49.62 
 
 		 359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3032  tRNA 2-selenouridine synthase  44.29 
 
 		 352 aa  250  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000366048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2556  tRNA 2-selenouridine synthase  49.8 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1645  tRNA 2-selenouridine synthase  50 
 
 		 377 aa  249  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1022  tRNA 2-selenouridine synthase  41.01 
 
 		 358 aa  240  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.239082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0816  rhodanese domain-containing protein  42.75 
 
 		 365 aa  238  9e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.400282  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1887  tRNA 2-selenouridine synthase  40.36 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227051  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2423  tRNA 2-selenouridine synthase  42.38 
 
 		 353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2084  tRNA 2-selenouridine synthase  45.29 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3656  tRNA 2-selenouridine synthase  46 
 
 		 371 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167107 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1926  tRNA 2-selenouridine synthase  41.99 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3290  tRNA 2-selenouridine synthase  45.36 
 
 		 350 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5476  tRNA 2-selenouridine synthase  40 
 
 		 353 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361534 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3604  tRNA 2-selenouridine synthase  44.29 
 
 		 350 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3478  tRNA 2-selenouridine synthase  41.7 
 
 		 348 aa  205  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.527623 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3349  tRNA 2-selenouridine synthase  44.76 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.382984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1545  tRNA 2-selenouridine synthase  38.85 
 
 		 347 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.256667  normal  0.0827797 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0523  tRNA 2-selenouridine synthase  44.62 
 
 		 365 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2327  tRNA 2-selenouridine synthase  34.21 
 
 		 356 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2041  tRNA 2-selenouridine synthase  33.77 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2384  tRNA 2-selenouridine synthase  38.21 
 
 		 345 aa  152  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.55321e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_10242  predicted protein  33.74 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.85356  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0278  tRNA 2-selenouridine synthase  42.93 
 
 		 344 aa  145  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3301  tRNA 2-selenouridine synthase  38.03 
 
 		 353 aa  145  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230491  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1887  tRNA 2-selenouridine synthase  35.55 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.739187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1525  tRNA 2-selenouridine synthase  36.43 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0672649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4991  tRNA 2-selenouridine synthase  37.35 
 
 		 358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0663375  normal  0.0359024 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2691  tRNA 2-selenouridine synthase  36.05 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.7307300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3130  tRNA 2-selenouridine synthase  37.89 
 
 		 358 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000658834  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1933  tRNA 2-selenouridine synthase  35.08 
 
 		 375 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.806249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0948  tRNA 2-selenouridine synthase  38.6 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1190  tRNA 2-selenouridine synthase  38.89 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000287258  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1955  tRNA 2-selenouridine synthase  30.88 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.190021  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2383  tRNA 2-selenouridine synthase  34.4 
 
 		 346 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07681  tRNA 2-selenouridine synthase  36.7 
 
 		 350 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104212  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0136  tRNA 2-selenouridine synthase  36.7 
 
 		 350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303131  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4284  rhodanese-like protein  37.61 
 
 		 339 aa  132  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812807 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2386  tRNA 2-selenouridine synthase  35.8 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0142  tRNA 2-selenouridine synthase  29.44 
 
 		 335 aa  125  9e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0985  tRNA 2-selenouridine synthase  30.04 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0043  tRNA 2-selenouridine synthase  33.5 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1198  tRNA 2-selenouridine synthase  36.48 
 
 		 347 aa  122  5e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0928  tRNA 2-selenouridine synthase  28.86 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3539  tRNA 2-selenouridine synthase  37.12 
 
 		 349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09351  tRNA 2-selenouridine synthase  30.28 
 
 		 346 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0875  tRNA 2-selenouridine synthase  32.2 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07211  tRNA 2-selenouridine synthase  31.3 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.989493  normal  0.414024 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1272  tRNA 2-selenouridine synthase  36.99 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3113  tRNA 2-selenouridine synthase  30.95 
 
 		 354 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16371  tRNA 2-selenouridine synthase  37.77 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.218284 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09341  tRNA 2-selenouridine synthase  31.56 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1304  tRNA 2-selenouridine synthase  29.96 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0227  tRNA 2-selenouridine synthase  34.14 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.254912  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0189  tRNA 2-selenouridine synthase  31.85 
 
 		 367 aa  106  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0697371 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0521  tRNA 2-selenouridine synthase  27.05 
 
 		 334 aa  106  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3619  tRNA 2-selenouridine synthase  39.89 
 
 		 367 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0160  tRNA 2-selenouridine synthase  37.78 
 
 		 365 aa  105  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.334237  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0608  tRNA 2-selenouridine synthase  26.69 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10081  tRNA 2-selenouridine synthase  29.48 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.741819  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1434  tRNA 2-selenouridine synthase  26.69 
 
 		 332 aa  102  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.719494  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0769  tRNA 2-selenouridine synthase  36.16 
 
 		 372 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.649423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0119  tRNA 2-selenouridine synthase  36.11 
 
 		 366 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0175  tRNA 2-selenouridine synthase  36.79 
 
 		 365 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1161  tRNA 2-selenouridine synthase  33.16 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.965775  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0134  tRNA 2-selenouridine synthase  30.38 
 
 		 372 aa  99.8  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0174  tRNA 2-selenouridine synthase  38.82 
 
 		 384 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4714  tRNA 2-selenouridine synthase  29.84 
 
 		 368 aa  99  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.728347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0169  tRNA 2-selenouridine synthase  38.82 
 
 		 369 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0272703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0176  tRNA 2-selenouridine synthase  36.16 
 
 		 368 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0301  tRNA 2-selenouridine synthase  38.83 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.812118  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0195  tRNA 2-selenouridine synthase  34.74 
 
 		 376 aa  96.3  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0172  tRNA 2-selenouridine synthase  36.69 
 
 		 368 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3544  tRNA 2-selenouridine synthase  36.09 
 
 		 369 aa  96.3  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0512  tRNA 2-selenouridine synthase  37.13 
 
 		 361 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114346  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14782  predicted protein  38.96 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.597893 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4081  tRNA 2-selenouridine synthase  36.09 
 
 		 368 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4342  tRNA 2-selenouridine synthase  29.72 
 
 		 369 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266604  hitchhiker  0.00245617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4183  tRNA 2-selenouridine synthase  36.09 
 
 		 368 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0794  hypothetical protein  35.59 
 
 		 366 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0697  tRNA 2-selenouridine synthase  33.9 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.710906 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>