More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2121 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  100 
 
 
428 aa  847    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  71.03 
 
 
428 aa  601  1.0000000000000001e-171  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  72.43 
 
 
429 aa  596  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  63.93 
 
 
429 aa  542  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  64.49 
 
 
427 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  60.71 
 
 
428 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  61.11 
 
 
413 aa  486  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  54.23 
 
 
426 aa  435  1e-121  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  50.93 
 
 
437 aa  409  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  50.35 
 
 
438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  50.12 
 
 
438 aa  404  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  49.65 
 
 
438 aa  404  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3708  hexulose-6-phosphate synthase  40.98 
 
 
207 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2273  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.6 
 
 
240 aa  134  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0250  hexulose-6-phosphate synthase  40.72 
 
 
228 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000013709  normal  0.0274377 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1184  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.92 
 
 
225 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0216  hexulose-6-phosphate synthase, putative  39.13 
 
 
210 aa  127  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3212  3-hexulose-6-phosphate synthase  38.35 
 
 
211 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2812  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.65 
 
 
210 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0607  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.16 
 
 
210 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0593  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.16 
 
 
210 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2736  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.65 
 
 
210 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.98 
 
 
229 aa  124  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2929  3-hexulose-6-phosphate synthase  37.13 
 
 
211 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000015488 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.19 
 
 
192 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1849  3-hexulose-6-phosphate synthase  37.2 
 
 
212 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0227  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.97 
 
 
227 aa  121  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.0096121 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.28 
 
 
225 aa  117  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1654  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.42 
 
 
209 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000168104  normal  0.271517 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.64 
 
 
224 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3043  hexulose-6-phosphate synthase  36.6 
 
 
215 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3049  hexulose-6-phosphate synthase  36.6 
 
 
215 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  39.18 
 
 
389 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  29.41 
 
 
615 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  29.22 
 
 
615 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5671  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.12 
 
 
211 aa  109  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.587401 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 
236 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.57 
 
 
187 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.78 
 
 
223 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.59 
 
 
222 aa  104  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.942951  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.75 
 
 
225 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.73 
 
 
232 aa  103  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
239 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  37.13 
 
 
393 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  33.15 
 
 
235 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.64 
 
 
233 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1871  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.42 
 
 
217 aa  101  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.563194  normal  0.356021 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  36.11 
 
 
224 aa  101  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  31.56 
 
 
237 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  36.14 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  39.6 
 
 
246 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  33.75 
 
 
216 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  34.83 
 
 
212 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  39.41 
 
 
235 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.74 
 
 
450 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.61 
 
 
212 aa  97.4  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  34.48 
 
 
223 aa  96.7  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  33.33 
 
 
396 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.13 
 
 
219 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  30.18 
 
 
403 aa  94.7  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.06 
 
 
234 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.53 
 
 
198 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  38.15 
 
 
222 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  38.67 
 
 
224 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  35.26 
 
 
237 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.73 
 
 
213 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  38.98 
 
 
215 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  33.84 
 
 
224 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  35.26 
 
 
237 aa  94  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  35.26 
 
 
237 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  32.23 
 
 
224 aa  93.6  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  34.43 
 
 
229 aa  93.2  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  38.38 
 
 
222 aa  93.2  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0568  hexulose-6-phosphate synthase  36.48 
 
 
217 aa  92.8  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  35.29 
 
 
227 aa  92.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  32.2 
 
 
228 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  33.5 
 
 
224 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.91 
 
 
222 aa  92.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.73 
 
 
209 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  35.86 
 
 
392 aa  91.3  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  33.51 
 
 
231 aa  90.5  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  31.33 
 
 
239 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  35.38 
 
 
391 aa  90.1  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.49 
 
 
214 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.67 
 
 
196 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.65 
 
 
207 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  35.96 
 
 
227 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.35 
 
 
209 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  32.06 
 
 
224 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.78 
 
 
232 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.23 
 
 
231 aa  89  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.67 
 
 
207 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  35.15 
 
 
393 aa  87.8  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.46 
 
 
208 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.17 
 
 
237 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  33.33 
 
 
225 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  29.7 
 
 
225 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  29.78 
 
 
248 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.57 
 
 
224 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.03 
 
 
231 aa  87.4  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>