More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0612 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
378 aa  775    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  57.6 
 
 
373 aa  451  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 
380 aa  209  6e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
416 aa  97.1  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
475 aa  96.7  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
405 aa  92.8  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
411 aa  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
406 aa  89.7  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
405 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
414 aa  87  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  27.44 
 
 
414 aa  87  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
405 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  25.66 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 
439 aa  82  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
397 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  24.5 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  29.96 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
376 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
377 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
360 aa  77  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 
409 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  26.64 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
516 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  29.19 
 
 
389 aa  73.6  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.25 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
404 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
447 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  24.53 
 
 
443 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  26.43 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6507  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 
383 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.961113  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  26.88 
 
 
723 aa  71.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
519 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
415 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1092  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3904  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
904 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  25.97 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0993  putative cell division protease FtsH-like protein  21.62 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
768 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
373 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
393 aa  67  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
457 aa  66.6  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
412 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
445 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.8 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  25.56 
 
 
407 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
390 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  24.35 
 
 
340 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  26 
 
 
564 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.23 
 
 
377 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.76 
 
 
427 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  24.76 
 
 
427 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
416 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
399 aa  63.9  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
398 aa  63.5  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
403 aa  63.5  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4821  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 
401 aa  63.5  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726751  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.35 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  28.35 
 
 
729 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3593  hypothetical protein  23.79 
 
 
332 aa  63.2  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
378 aa  63.2  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1065  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
369 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.912454 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
517 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>