More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8523 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 323 aa  664    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  49.36 
 
 		 321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  51.19 
 
 		 323 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  50.17 
 
 		 336 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  47.78 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  51.6 
 
 		 334 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  51.77 
 
 		 336 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  46.79 
 
 		 321 aa  295  6e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  52.35 
 
 		 311 aa  292  5e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  48.36 
 
 		 329 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  46.35 
 
 		 324 aa  288  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  49.48 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  46.67 
 
 		 303 aa  287  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  43.49 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  45.72 
 
 		 323 aa  282  4.0000000000000003e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.11 
 
 		 639 aa  282  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  47.04 
 
 		 293 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  47.89 
 
 		 293 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  47.69 
 
 		 284 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  49.11 
 
 		 288 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  47.49 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  45.25 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  46.18 
 
 		 296 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  46.95 
 
 		 356 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  45.61 
 
 		 284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  46.04 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  46.88 
 
 		 296 aa  268  7e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  45.64 
 
 		 297 aa  268  8.999999999999999e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  47.83 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  46.81 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  43.71 
 
 		 315 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  42.81 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  44.77 
 
 		 283 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  43.86 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  46.4 
 
 		 289 aa  259  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  46.43 
 
 		 281 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  43.49 
 
 		 296 aa  256  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  45.13 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  43.46 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  44.6 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  45.64 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  42.76 
 
 		 296 aa  250  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  45.67 
 
 		 290 aa  248  8e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  43.21 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  47.14 
 
 		 293 aa  242  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  42.6 
 
 		 300 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  41.22 
 
 		 303 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  43.51 
 
 		 290 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  43.51 
 
 		 290 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  43.51 
 
 		 290 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  47.35 
 
 		 291 aa  225  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  37.58 
 
 		 374 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  39.79 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  42.35 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  40.41 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  39.1 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  37.89 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  32.26 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  32.64 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  51.13 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  50.53 
 
 		 99 aa  105  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  31.41 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  28.52 
 
 		 300 aa  99.4  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 296 aa  95.9  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  27.94 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  30.72 
 
 		 289 aa  92.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  28.57 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  27.15 
 
 		 314 aa  89.7  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 		 284 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  38.66 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  26.17 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  28.77 
 
 		 462 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 294 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 296 aa  86.3  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 295 aa  85.9  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  23.66 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  27.9 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  27.41 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  28.47 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>