171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4740 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  80.41 
 
 
252 aa  397  1e-110  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  61.29 
 
 
255 aa  301  7e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  62.55 
 
 
283 aa  295  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  62.55 
 
 
271 aa  292  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  60.96 
 
 
265 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  65.94 
 
 
265 aa  278  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  59.35 
 
 
261 aa  266  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  57.47 
 
 
261 aa  264  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  59.04 
 
 
257 aa  258  7e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  57.26 
 
 
265 aa  254  1e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  59.69 
 
 
264 aa  253  2e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  54.12 
 
 
277 aa  248  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  58.33 
 
 
257 aa  246  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  52.78 
 
 
274 aa  245  5e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  55.27 
 
 
259 aa  243  2e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  55.27 
 
 
263 aa  242  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  54.85 
 
 
647 aa  241  9e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  47.57 
 
 
272 aa  239  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  52 
 
 
269 aa  238  7e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  52.32 
 
 
257 aa  236  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  56.9 
 
 
258 aa  231  7e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  50.98 
 
 
272 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  51.94 
 
 
264 aa  219  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  54.05 
 
 
290 aa  214  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  51.72 
 
 
254 aa  211  9e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  51.72 
 
 
248 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  44.72 
 
 
259 aa  209  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  51.28 
 
 
248 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  50.63 
 
 
249 aa  201  1e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  47.66 
 
 
247 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  45.76 
 
 
251 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  49.58 
 
 
252 aa  184  2e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  46.67 
 
 
256 aa  182  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  38.3 
 
 
253 aa  180  2e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  47.44 
 
 
249 aa  173  3e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  36.24 
 
 
257 aa  164  1e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  33.74 
 
 
260 aa  163  2e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  46.96 
 
 
244 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  43.11 
 
 
248 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  35.83 
 
 
279 aa  149  4e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  41.56 
 
 
254 aa  146  4e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  34.86 
 
 
276 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  1.40392e-07  hitchhiker  9.02529e-10 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  34.86 
 
 
276 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  26.95 
 
 
254 aa  75.5  8e-13  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  31.47 
 
 
274 aa  70.9  2e-11  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  3.37661e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  36.96 
 
 
218 aa  63.9  2e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  42.73 
 
 
246 aa  62.4  6e-09  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  25.74 
 
 
257 aa  62.4  6e-09  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  28.19 
 
 
258 aa  62  9e-09  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  32.52 
 
 
397 aa  57.8  2e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  28.84 
 
 
237 aa  57  3e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.37 
 
 
261 aa  56.6  4e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 
262 aa  55.8  6e-07  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  26.36 
 
 
274 aa  55.5  8e-07  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  29.24 
 
 
239 aa  53.9  3e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  29.53 
 
 
260 aa  52.8  6e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  3.26151e-06  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.55 
 
 
259 aa  52.4  6e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  43.53 
 
 
275 aa  52.4  7e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
297 aa  52  8e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3452  hypothetical protein  23.92 
 
 
273 aa  51.6  1e-05  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281711  normal  0.0529388 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1676  alpha/beta hydrolase  25.55 
 
 
236 aa  50.8  2e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0135197  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0792  hypothetical protein  28.91 
 
 
167 aa  50.8  2e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  26.97 
 
 
259 aa  50.4  2e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.84 
 
 
248 aa  50.8  2e-05  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1379  protein of unknown function UPF0227  25.12 
 
 
214 aa  50.1  3e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_003296  RS03173  hypothetical protein  35.4 
 
 
272 aa  49.3  6e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188182 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.51 
 
 
371 aa  49.3  6e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.51 
 
 
371 aa  49.3  6e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  29.21 
 
 
264 aa  49.3  7e-05  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  42.39 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  34.25 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  25.66 
 
 
361 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 
267 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 
270 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 
311 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
308 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.43 
 
 
371 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  28.11 
 
 
252 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 
387 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  34.19 
 
 
272 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  32.06 
 
 
290 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  42.35 
 
 
387 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  34.13 
 
 
311 aa  46.2  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 
271 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  31.37 
 
 
306 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  26.46 
 
 
415 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  1.34708e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  27.63 
 
 
402 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4198  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 
259 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4168  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 
259 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712942 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25.97 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4392  putative dioxygenase  27.66 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.537049  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  27.66 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.14 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  27.66 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>