More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1501 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  42.07 
 
 		 928 aa  691    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  42.07 
 
 		 928 aa  691    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  39.88 
 
 		 916 aa  651    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  42.07 
 
 		 928 aa  691    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  79.08 
 
 		 1047 aa  1644    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  40.93 
 
 		 928 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  41.34 
 
 		 947 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  41.45 
 
 		 915 aa  684    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  40.93 
 
 		 928 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  48.92 
 
 		 941 aa  881    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  41.38 
 
 		 946 aa  658    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  50.99 
 
 		 937 aa  956    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  39.44 
 
 		 936 aa  651    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  54.86 
 
 		 1020 aa  1013    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1930  DNA polymerase I  40.08 
 
 		 927 aa  652    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173956  normal  0.0298694 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  56.6 
 
 		 979 aa  1090    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  40.99 
 
 		 930 aa  680    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  42.07 
 
 		 928 aa  691    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  55.63 
 
 		 1004 aa  1055    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  40.93 
 
 		 928 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  43.46 
 
 		 939 aa  704    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  41.87 
 
 		 928 aa  687    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  56.85 
 
 		 976 aa  1091    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  60.2 
 
 		 1043 aa  1197    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  41.03 
 
 		 917 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  41.05 
 
 		 932 aa  689    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  40.97 
 
 		 917 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  39.39 
 
 		 922 aa  646    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  41.61 
 
 		 941 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  41.55 
 
 		 915 aa  686    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  56.23 
 
 		 915 aa  643    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  54.84 
 
 		 1010 aa  1058    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  50.25 
 
 		 932 aa  923    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  53.78 
 
 		 973 aa  976    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  54.99 
 
 		 1025 aa  1036    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  41.05 
 
 		 932 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  51.09 
 
 		 937 aa  956    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  42.43 
 
 		 933 aa  696    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  39.67 
 
 		 921 aa  645    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  39.52 
 
 		 936 aa  639    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  56.45 
 
 		 978 aa  1092    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  40.85 
 
 		 942 aa  659    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  54.38 
 
 		 979 aa  1056    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  62.28 
 
 		 1000 aa  1224    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  55.63 
 
 		 999 aa  1048    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  40.29 
 
 		 939 aa  710    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  39.86 
 
 		 921 aa  645    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  58.49 
 
 		 937 aa  717    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  42.43 
 
 		 915 aa  695    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  40.08 
 
 		 934 aa  681    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  42.27 
 
 		 924 aa  687    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  40.93 
 
 		 928 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  42.07 
 
 		 928 aa  691    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  78.8 
 
 		 1047 aa  1632    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  40.2 
 
 		 945 aa  664    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  54.35 
 
 		 1032 aa  1043    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  49.45 
 
 		 945 aa  848    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  57.35 
 
 		 943 aa  674    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0390  DNA polymerase I  41.05 
 
 		 923 aa  641    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  57.21 
 
 		 929 aa  676    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  39.76 
 
 		 957 aa  642    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  41.55 
 
 		 937 aa  675    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  53.01 
 
 		 1021 aa  1034    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  39.76 
 
 		 910 aa  643    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1729  DNA polymerase I  41.16 
 
 		 944 aa  672    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  40.61 
 
 		 934 aa  688    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  39.39 
 
 		 921 aa  655    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  54.62 
 
 		 1033 aa  1050    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  41.05 
 
 		 928 aa  683    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  54.24 
 
 		 1014 aa  1025    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  38.2 
 
 		 988 aa  640    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  42.07 
 
 		 928 aa  692    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1841  DNA polymerase I  41.17 
 
 		 936 aa  660    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721717  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  51.94 
 
 		 968 aa  992    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  58.74 
 
 		 935 aa  724    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0625  DNA polymerase I  48.66 
 
 		 937 aa  838    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.480617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  40.97 
 
 		 917 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  38.67 
 
 		 928 aa  652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  57.16 
 
 		 978 aa  1092    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  41.03 
 
 		 928 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  39.54 
 
 		 930 aa  670    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  39.98 
 
 		 923 aa  664    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  39.36 
 
 		 951 aa  707    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  78.77 
 
 		 1060 aa  1658    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  39.86 
 
 		 933 aa  658    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  39.11 
 
 		 918 aa  642    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  42.07 
 
 		 928 aa  691    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  41.05 
 
 		 932 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0678  DNA polymerase I  92.52 
 
 		 1016 aa  1870    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80797  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  52.72 
 
 		 928 aa  1002    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  41.93 
 
 		 917 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  41.32 
 
 		 913 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  56.82 
 
 		 940 aa  680    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1148  DNA-directed DNA polymerase  40.97 
 
 		 937 aa  654    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  41.96 
 
 		 917 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  40.93 
 
 		 922 aa  659    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1478  DNA polymerase I  41.09 
 
 		 941 aa  664    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.495398 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  40.97 
 
 		 917 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  40.6 
 
 		 943 aa  661    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  43.81 
 
 		 911 aa  737    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>