131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0769 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
213 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  88.68 
 
 
213 aa  370  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  64.29 
 
 
211 aa  265  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  56.86 
 
 
212 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  52.91 
 
 
217 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.19 
 
 
219 aa  135  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.87 
 
 
202 aa  117  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.06 
 
 
208 aa  112  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.02 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.5 
 
 
206 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.3 
 
 
220 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.25 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.25 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  29.65 
 
 
321 aa  96.7  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.16 
 
 
199 aa  95.9  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0335  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.2 
 
 
214 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0186291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.72 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.58 
 
 
207 aa  82  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  29.44 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  29.36 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  29.44 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  29.44 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.05 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2682  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.6 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.32 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.92 
 
 
406 aa  68.9  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132826  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.12 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.62 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.7 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.12 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  25 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1309  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.47 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.632224  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.57 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.13 
 
 
207 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  28.12 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  26.26 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2405  CheC family protein  28.57 
 
 
182 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  26.15 
 
 
194 aa  60.1  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.6 
 
 
331 aa  59.7  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2876  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.69 
 
 
406 aa  59.3  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.87 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0236  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.87 
 
 
403 aa  58.9  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.97 
 
 
205 aa  58.9  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  26.53 
 
 
417 aa  58.2  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.67 
 
 
331 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.74 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  29.29 
 
 
334 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2106  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1494  response regulator  28.57 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00101274  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  28.06 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.54 
 
 
546 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1134  CheC family phosphatase  28.57 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1414  CheC family phosphatase  28.57 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0704685  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3280  CheC family phosphatase  28.57 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0228974  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3166  CheC family phosphatase  28.57 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2400  CheC family phosphatase  28.57 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188892  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.54 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  26.92 
 
 
334 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.06 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.51 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.06 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.11 
 
 
204 aa  55.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.56 
 
 
204 aa  55.5  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  23.98 
 
 
338 aa  55.5  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  25.67 
 
 
331 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  27.13 
 
 
331 aa  54.7  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1981  hypothetical protein  22.45 
 
 
198 aa  54.7  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  27.21 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.5 
 
 
370 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  28.68 
 
 
331 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  28.68 
 
 
331 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.98 
 
 
331 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  28.68 
 
 
331 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  28.68 
 
 
331 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.2 
 
 
331 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  28.68 
 
 
331 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0956  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.39 
 
 
418 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  28.68 
 
 
331 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  28.68 
 
 
331 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.62 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0942  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.54 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31157  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.4 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.17 
 
 
357 aa  52.8  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0935  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.3 
 
 
212 aa  52.4  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.34 
 
 
201 aa  52  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  29.5 
 
 
331 aa  52  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5174  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.42 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5685  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.42 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74554  hitchhiker  0.00173669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0920  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.68 
 
 
211 aa  51.6  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.131653  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4550  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.42 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0686054  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  28.68 
 
 
331 aa  51.6  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.66 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.17 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0876  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.17 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3147  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.69 
 
 
422 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.71 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1136  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.35 
 
 
211 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.253061  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.37 
 
 
335 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.98 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.37 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>