More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0471 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 254 aa  519  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  84.25 
 
 		 254 aa  447  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  76.05 
 
 		 253 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  37.6 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  38.3 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  36.8 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0754  extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00633321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  34.96 
 
 		 251 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1164  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.065416  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0340  extracellular solute-binding protein  36.48 
 
 		 248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.419937  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0067  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.571905  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  35.77 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  34.71 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  32.54 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 		 253 aa  119  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0564  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  32.54 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  29.6 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  28.96 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1630  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.07 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  31.37 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.46 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 264 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0283  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.37574  hitchhiker  0.000912938 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.62 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.18 
 
 		 264 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.18 
 
 		 264 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.18 
 
 		 284 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.18 
 
 		 264 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  29.62 
 
 		 264 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.18 
 
 		 264 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.18 
 
 		 264 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.18 
 
 		 264 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  33.18 
 
 		 283 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  27.17 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  27.17 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  30.95 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.1 
 
 		 257 aa  101  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.1 
 
 		 257 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  31.43 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  30.94 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2345  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.949438  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  28.25 
 
 		 252 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.07 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1805  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0545186  unclonable  0.00000000660342 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 284 aa  99  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.69 
 
 		 266 aa  99  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 266 aa  98.6  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0378  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 294 aa  98.6  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.150141  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1531  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.04 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000230414  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  28.57 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1739  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.376685 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.43 
 
 		 320 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  27.43 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  26.98 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  28.57 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  28.57 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.43 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  32.13 
 
 		 257 aa  95.9  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 260 aa  95.5  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 		 286 aa  95.5  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  26.19 
 
 		 271 aa  95.1  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  26.59 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0172  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30 
 
 		 513 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.76 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  27.34 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3545  solute-binding family 3 protein  31.25 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3742  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 261 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1804  extracellular solute-binding protein family 3  29.02 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.16 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1930  extracellular solute-binding protein family 3  26.74 
 
 		 248 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000351018  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  28.89 
 
 		 258 aa  92.4  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  26.58 
 
 		 266 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 266 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>