More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0410 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  91.69 
 
 		 397 aa  699    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  92.7 
 
 		 397 aa  706    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  782    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  75.31 
 
 		 397 aa  593  1e-168  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  71.79 
 
 		 397 aa  593  1e-168  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  74.56 
 
 		 397 aa  588  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  73.8 
 
 		 397 aa  590  1e-167  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  70.78 
 
 		 397 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  71.03 
 
 		 397 aa  558  1e-158  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  71.03 
 
 		 397 aa  560  1e-158  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  70.53 
 
 		 397 aa  551  1e-156  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  54.91 
 
 		 395 aa  418  1e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  34.56 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  31.68 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  30.12 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  31.86 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  31.53 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  29.29 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  28.96 
 
 		 401 aa  170  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  29.54 
 
 		 402 aa  169  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  28.88 
 
 		 414 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  31.33 
 
 		 443 aa  169  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  30.54 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  30.17 
 
 		 409 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  29.56 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  30.54 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  29.93 
 
 		 400 aa  167  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  30.17 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  29.76 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  29.37 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  29.68 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  29.38 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  30.09 
 
 		 408 aa  160  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  26.63 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  26.52 
 
 		 402 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  27.53 
 
 		 658 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  29.44 
 
 		 410 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  28.1 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 		 406 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  29.38 
 
 		 644 aa  153  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  28.05 
 
 		 643 aa  152  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  29.92 
 
 		 641 aa  152  7e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  26.85 
 
 		 402 aa  152  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0746  putative ABC transport system permease protein  31.46 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.489511 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  27.9 
 
 		 401 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  28.99 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  27.25 
 
 		 411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0635  ABC transporter, inner membrane subunit  27.85 
 
 		 435 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000706682  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  28.43 
 
 		 657 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  29.37 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  29.37 
 
 		 410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  27.32 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  25.36 
 
 		 399 aa  146  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  29.02 
 
 		 387 aa  146  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0954  hypothetical protein  27.32 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 406 aa  146  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  29.73 
 
 		 409 aa  146  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  29.73 
 
 		 409 aa  146  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  29.93 
 
 		 405 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  29.93 
 
 		 405 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  28.01 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  28.01 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  28.26 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  30.33 
 
 		 642 aa  145  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  29.02 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  28.54 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  28.02 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  28.27 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  26.62 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  29.41 
 
 		 647 aa  144  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  28.34 
 
 		 414 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  28.71 
 
 		 641 aa  143  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  25.87 
 
 		 406 aa  143  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  29.07 
 
 		 392 aa  143  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  27.09 
 
 		 402 aa  143  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.92 
 
 		 391 aa  143  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  28.22 
 
 		 641 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  25.6 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  27.7 
 
 		 407 aa  141  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  27.98 
 
 		 641 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  28.17 
 
 		 652 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.71 
 
 		 371 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  29.1 
 
 		 399 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  26.7 
 
 		 656 aa  139  6e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  27.73 
 
 		 415 aa  139  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  26.97 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  26.83 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  28.3 
 
 		 402 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  30.47 
 
 		 670 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  27.27 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  28.57 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  28.1 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  26.24 
 
 		 643 aa  137  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  26.27 
 
 		 431 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  28.36 
 
 		 405 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  27.86 
 
 		 412 aa  137  5e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  31.92 
 
 		 409 aa  137  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  28.08 
 
 		 696 aa  137  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>