More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0057 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0057  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  100 
 
 
312 aa  629  1e-179  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.72588  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1152  ABC transporter related  94.23 
 
 
312 aa  600  1e-170  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0766  ABC transporter related  93.27 
 
 
312 aa  572  1e-162  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.812823  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0831  ABC transporter related  72.29 
 
 
314 aa  469  1e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  39.47 
 
 
351 aa  229  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  39.56 
 
 
348 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  46.98 
 
 
347 aa  218  8e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1980  ABC transporter related  49.35 
 
 
355 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.220202 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2134  ABC transporter related protein  38.82 
 
 
368 aa  214  1e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.86 
 
 
382 aa  214  2e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  3.54755e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  44.35 
 
 
335 aa  211  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  42.92 
 
 
368 aa  209  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.35 
 
 
402 aa  207  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0285  ABC transporter related  37.17 
 
 
334 aa  206  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0897858  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0974  ABC transporter related  35.6 
 
 
328 aa  206  5e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0227339  unclonable  1.44331e-13 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  34.62 
 
 
345 aa  206  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  44.7 
 
 
355 aa  203  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  45.73 
 
 
359 aa  203  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  44.7 
 
 
355 aa  203  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  34.95 
 
 
358 aa  202  6e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2123  ABC transporter related  43.58 
 
 
542 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  45.02 
 
 
356 aa  202  9e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  38.72 
 
 
346 aa  201  9e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1829  ABC transporter related  34.57 
 
 
328 aa  201  1e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.853496 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1105  ABC transporter related  39.46 
 
 
319 aa  201  1e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.788183  normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  41.27 
 
 
370 aa  201  1e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1525  ABC transporter related  47.84 
 
 
367 aa  201  1e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.571493  hitchhiker  0.00153278 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  33.72 
 
 
380 aa  201  1e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1447  ABC transporter related  47.84 
 
 
367 aa  200  2e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  43.29 
 
 
367 aa  201  2e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  43.29 
 
 
367 aa  201  2e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  38.72 
 
 
346 aa  201  2e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  42.21 
 
 
371 aa  201  2e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  40.52 
 
 
379 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 
353 aa  199  4e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  42.67 
 
 
370 aa  199  5e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  34.52 
 
 
342 aa  199  6e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  40.95 
 
 
355 aa  198  8e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  40.37 
 
 
329 aa  197  1e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.08 
 
 
352 aa  197  1e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  42.29 
 
 
369 aa  197  1e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  38.68 
 
 
333 aa  198  1e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2228  ABC transporter related  44.59 
 
 
241 aa  197  2e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0571204  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5307  ABC transporter related  31.29 
 
 
355 aa  197  2e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.853728 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0301  ABC transporter related  39.52 
 
 
386 aa  196  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0922  ABC transporter related  40.65 
 
 
353 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.65 
 
 
336 aa  196  5e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  36.76 
 
 
367 aa  196  5e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  40.65 
 
 
331 aa  196  5e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  36.46 
 
 
367 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  34.19 
 
 
381 aa  196  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  36.8 
 
 
356 aa  196  6e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.08 
 
 
331 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  3.08593e-06 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  36.05 
 
 
323 aa  195  7e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1819  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.68 
 
 
353 aa  195  8e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147813  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.89 
 
 
338 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1759  ABC transporter related  41.15 
 
 
353 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  40.71 
 
 
386 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  39.22 
 
 
384 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1299  ABC transporter related protein  41.38 
 
 
394 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0956135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  43.78 
 
 
381 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  33.71 
 
 
384 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2005  ABC transporter related  40.37 
 
 
378 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833855  normal  0.0467613 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  41.63 
 
 
372 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  41.77 
 
 
356 aa  194  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0754  ABC transporter related  42.24 
 
 
363 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.95 
 
 
362 aa  193  4e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1022  ABC transporter related  40.74 
 
 
353 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  36.21 
 
 
333 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  41.47 
 
 
357 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  43.32 
 
 
371 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  37.07 
 
 
403 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  35.84 
 
 
374 aa  192  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  43.67 
 
 
368 aa  192  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  42.4 
 
 
371 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  41.03 
 
 
386 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  42.31 
 
 
363 aa  192  8e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  41.03 
 
 
386 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.99 
 
 
366 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2630  ABC transporter related  40.83 
 
 
378 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0792503  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2631  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.54 
 
 
358 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  40.77 
 
 
342 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2784  ABC-type transporter, ATPase component  40.95 
 
 
383 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07726e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.4 
 
 
378 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  32.23 
 
 
349 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  42.31 
 
 
364 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1177  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
331 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  35.01 
 
 
402 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1568  ABC transporter related  43.1 
 
 
323 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  41.94 
 
 
389 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.65 
 
 
372 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.23 
 
 
343 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  41.35 
 
 
367 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
335 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0387  ABC transporter related  46.12 
 
 
367 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1439  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
327 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000273581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 
333 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1375  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
327 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.57634e-08 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
331 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.78 
 
 
382 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>