More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_3041 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  67.37 
 
 		 537 aa  704    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  68.85 
 
 		 545 aa  717    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  67.12 
 
 		 538 aa  689    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  65.26 
 
 		 538 aa  696    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  66.73 
 
 		 537 aa  711    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  71.24 
 
 		 536 aa  737    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  67.99 
 
 		 538 aa  723    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  67.12 
 
 		 552 aa  704    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  67.64 
 
 		 531 aa  705    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  65.9 
 
 		 539 aa  686    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  66.48 
 
 		 537 aa  720    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  68.02 
 
 		 541 aa  711    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  69.47 
 
 		 545 aa  719    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  66.16 
 
 		 540 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  65.77 
 
 		 536 aa  697    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  69.08 
 
 		 544 aa  712    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  68.85 
 
 		 545 aa  717    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  69.5 
 
 		 568 aa  701    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  67.57 
 
 		 534 aa  712    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  67.37 
 
 		 537 aa  704    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  66.92 
 
 		 535 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 572 aa  1118    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  69 
 
 		 532 aa  726    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  66.99 
 
 		 533 aa  702    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  69.23 
 
 		 560 aa  723    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  69.28 
 
 		 536 aa  714    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  67.18 
 
 		 535 aa  702    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  63.71 
 
 		 537 aa  669    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  61.97 
 
 		 544 aa  633  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  60.42 
 
 		 538 aa  616  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  58.2 
 
 		 559 aa  613  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  64.02 
 
 		 516 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  59.26 
 
 		 535 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  59.26 
 
 		 535 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  59.26 
 
 		 534 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  59.66 
 
 		 544 aa  596  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  59.62 
 
 		 548 aa  592  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0040  transcription elongation factor NusA  55.58 
 
 		 590 aa  584  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  65.54 
 
 		 506 aa  581  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3819  transcription elongation factor NusA  60.04 
 
 		 529 aa  568  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  64.18 
 
 		 523 aa  547  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  50.97 
 
 		 506 aa  482  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0562  transcription elongation factor NusA  42.86 
 
 		 517 aa  430  1e-119  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.535647  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0468  transcription elongation factor NusA  43.43 
 
 		 517 aa  418  9.999999999999999e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0554  NusA antitermination factor  47.44 
 
 		 493 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557873  normal  0.218927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0390  transcription termination factor NusA  47.44 
 
 		 493 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1949  transcription elongation factor NusA  47.55 
 
 		 498 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.0311483 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  44.9 
 
 		 495 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  46.72 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1316  transcription elongation factor NusA  43.82 
 
 		 499 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3349  transcription elongation factor NusA  46.82 
 
 		 497 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451805  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1228  transcription elongation factor NusA  44.25 
 
 		 493 aa  401  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00625796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03397  transcription elongation factor NusA  44.85 
 
 		 495 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  45.81 
 
 		 490 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0820  transcription elongation factor NusA  45.49 
 
 		 493 aa  400  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  44.04 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1601  transcription elongation factor NusA  44.04 
 
 		 503 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1691  transcription elongation factor NusA  44.97 
 
 		 491 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349056  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  43.22 
 
 		 492 aa  399  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1865  transcription elongation factor NusA  43.25 
 
 		 495 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.253606  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2709  transcription elongation factor NusA  47.21 
 
 		 493 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002608  transcription termination protein NusA  44.85 
 
 		 495 aa  399  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000346209  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03036  transcription elongation factor NusA  44.61 
 
 		 495 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0536  NusA antitermination factor  44.61 
 
 		 495 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0202  transcription elongation factor NusA  44.35 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504361  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01759  transcription elongation factor NusA  44.75 
 
 		 498 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320518  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3609  transcription elongation factor NusA  45.97 
 
 		 493 aa  395  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02987  hypothetical protein  44.61 
 
 		 495 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3582  transcription elongation factor NusA  43.39 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3644  transcription elongation factor NusA  43.39 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3361  transcription elongation factor NusA  44.61 
 
 		 495 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0352386  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3653  transcription elongation factor NusA  44.61 
 
 		 495 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.588616  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3545  transcription elongation factor NusA  43.39 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.929482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3476  transcription elongation factor NusA  43.39 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555068  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0529  transcription elongation factor NusA  44.61 
 
 		 495 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000129927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3477  transcription elongation factor NusA  43.39 
 
 		 500 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3465  transcription elongation factor NusA  44.4 
 
 		 495 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.246943  normal  0.841765 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1094  transcription elongation factor NusA  43.85 
 
 		 493 aa  394  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3606  transcription elongation factor NusA  43.84 
 
 		 495 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0209266  normal  0.0368341 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0173  transcription elongation factor NusA  43.35 
 
 		 495 aa  391  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000303519  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3731  transcription elongation factor NusA  44.61 
 
 		 495 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00415908  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3597  transcription elongation factor NusA  44.61 
 
 		 495 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000179276  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3602  transcription elongation factor NusA  44.18 
 
 		 495 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.761318  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3992  transcription elongation factor NusA  44.61 
 
 		 495 aa  391  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000690041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3466  transcription elongation factor NusA  44.4 
 
 		 496 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4490  transcription elongation factor NusA  44.61 
 
 		 495 aa  392  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42830  transcription elongation factor NusA  46.78 
 
 		 493 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0178  transcription elongation factor NusA  44.35 
 
 		 503 aa  392  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.125443  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4713  transcription elongation factor NusA  45.97 
 
 		 493 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0720  transcription elongation factor NusA  45.75 
 
 		 493 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0992944 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2821  transcription elongation factor NusA  44.76 
 
 		 492 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2690  transcription elongation factor NusA  44.56 
 
 		 492 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5463  transcription elongation factor NusA  44.42 
 
 		 493 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1922  NusA antitermination factor  42.57 
 
 		 492 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2029  transcription elongation factor NusA  42.23 
 
 		 491 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1002  transcription elongation factor NusA  44.66 
 
 		 501 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1730  transcription elongation factor NusA  45.06 
 
 		 491 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1116  transcription elongation factor NusA  41.85 
 
 		 491 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.749384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4578  transcription elongation factor NusA  45.97 
 
 		 493 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00867288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62770  transcription elongation factor NusA  44.42 
 
 		 493 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>