169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2688 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  68.77 
 
 
821 aa  1047    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  100 
 
 
818 aa  1610    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  41.24 
 
 
911 aa  508  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  41.15 
 
 
2082 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  40.03 
 
 
784 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  44.33 
 
 
717 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  44.93 
 
 
714 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  36.48 
 
 
807 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  38.98 
 
 
778 aa  395  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.59 
 
 
837 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  39.43 
 
 
792 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  38.9 
 
 
776 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  33.96 
 
 
743 aa  350  4e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  46.24 
 
 
461 aa  307  5.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.29 
 
 
1679 aa  300  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  47.42 
 
 
1919 aa  295  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  42.42 
 
 
461 aa  279  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  44.06 
 
 
449 aa  269  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  45.97 
 
 
547 aa  264  6e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  32.4 
 
 
1126 aa  257  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  30.23 
 
 
1207 aa  249  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  31.55 
 
 
1222 aa  232  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  31.16 
 
 
1187 aa  227  7e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  39.36 
 
 
1129 aa  225  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.55 
 
 
563 aa  206  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  37.5 
 
 
469 aa  205  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.59 
 
 
554 aa  204  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  41.82 
 
 
560 aa  203  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  38.01 
 
 
835 aa  198  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  39.31 
 
 
593 aa  197  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.99 
 
 
561 aa  196  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.11 
 
 
417 aa  194  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  36.21 
 
 
363 aa  191  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  36.21 
 
 
363 aa  191  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  40.74 
 
 
579 aa  190  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  38.54 
 
 
558 aa  190  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  42.5 
 
 
376 aa  188  4e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.75 
 
 
553 aa  188  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.24 
 
 
556 aa  187  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  41.09 
 
 
477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  37.71 
 
 
726 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.88 
 
 
567 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  36.63 
 
 
1848 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  38.4 
 
 
551 aa  181  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  42.47 
 
 
681 aa  178  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  40.47 
 
 
569 aa  178  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  36.66 
 
 
558 aa  178  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.06 
 
 
692 aa  178  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  37.78 
 
 
553 aa  178  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.83 
 
 
555 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  36.66 
 
 
577 aa  171  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.57 
 
 
921 aa  171  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.37 
 
 
555 aa  170  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  38.86 
 
 
546 aa  169  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  36.44 
 
 
403 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  37.87 
 
 
554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  36.92 
 
 
810 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.74 
 
 
706 aa  156  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.7 
 
 
570 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  36.13 
 
 
389 aa  154  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  38.08 
 
 
566 aa  154  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  32.62 
 
 
597 aa  147  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  33.43 
 
 
341 aa  145  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  33.42 
 
 
737 aa  144  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  22.85 
 
 
728 aa  144  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.27 
 
 
817 aa  144  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  32.43 
 
 
443 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.13 
 
 
941 aa  136  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.53 
 
 
787 aa  134  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  28.87 
 
 
575 aa  131  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.36 
 
 
1147 aa  130  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  35.52 
 
 
638 aa  130  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  29.31 
 
 
900 aa  128  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  33.23 
 
 
624 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  32.01 
 
 
544 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.65 
 
 
535 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  30.3 
 
 
396 aa  127  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  32.39 
 
 
602 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  35.27 
 
 
618 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 
745 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  31.36 
 
 
418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  31.99 
 
 
328 aa  118  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  32.53 
 
 
454 aa  114  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  27.11 
 
 
727 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  30.7 
 
 
298 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  28.69 
 
 
643 aa  112  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  29.75 
 
 
1312 aa  111  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  29.35 
 
 
547 aa  110  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  29.63 
 
 
390 aa  110  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  28.93 
 
 
447 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  33.98 
 
 
332 aa  107  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  29.74 
 
 
375 aa  106  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3497  beta-lactamase inhibitory protein II  29.67 
 
 
295 aa  105  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  27.62 
 
 
450 aa  105  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1846  beta-lactamase inhibitory protein II  29.38 
 
 
295 aa  102  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  27.1 
 
 
2816 aa  101  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.91 
 
 
454 aa  101  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  25.47 
 
 
558 aa  100  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50520  predicted protein  26.5 
 
 
657 aa  100  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  28.42 
 
 
399 aa  94.4  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>