81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0070 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  403  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  38.94 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  36.65 
 
 
192 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  35.15 
 
 
216 aa  98.2  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  31.58 
 
 
202 aa  88.2  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  29 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  29 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  27.6 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  27.08 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  26.24 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  26.56 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  30 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  36.36 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  31.93 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  23.47 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  30.26 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  27.64 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0401  hypothetical protein  26 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  28.95 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  43.14 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  29.65 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  26.02 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  27.51 
 
 
207 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  25.13 
 
 
207 aa  62  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1191  hypothetical protein  30.69 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  31.25 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  34.21 
 
 
196 aa  58.9  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  23.96 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4131  hypothetical protein  25.89 
 
 
206 aa  58.5  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000668989 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  23.9 
 
 
207 aa  58.2  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  27.55 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  25.13 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0174  Sterol-binding domain protein  31.12 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  30.12 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  28.19 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1099  sterol-binding domain-containing protein  29.63 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  30.88 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  26.67 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  28.19 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  26.19 
 
 
211 aa  56.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  24.62 
 
 
207 aa  56.2  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  26.63 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  26.63 
 
 
206 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  26.02 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  28.64 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  27.62 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  32.71 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  32.71 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  22.61 
 
 
207 aa  52.4  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  27.64 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  41.38 
 
 
189 aa  52.4  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  29.7 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  26.13 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  28.19 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  28.5 
 
 
201 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  26.67 
 
 
206 aa  48.9  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  27.5 
 
 
210 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  28 
 
 
201 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  28.36 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  28.36 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  28.36 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  28.36 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  28.36 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  29.08 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  28.36 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  28.36 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  27.5 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  25.14 
 
 
211 aa  45.4  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  30.43 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  33 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  33.33 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  25 
 
 
206 aa  43.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  30.48 
 
 
202 aa  42.4  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  30.22 
 
 
203 aa  42  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4246  Sterol-binding domain protein  32 
 
 
207 aa  41.6  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>