264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0011 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.36 
 
 
689 aa  663  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.36 
 
 
689 aa  662  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1221  glycine--tRNA ligase  55.01 
 
 
696 aa  668  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.27 
 
 
689 aa  638  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  53.68 
 
 
693 aa  697  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.42 
 
 
688 aa  654  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.81 
 
 
689 aa  635  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  100 
 
 
693 aa  1373  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  56.34 
 
 
696 aa  730  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.91 
 
 
692 aa  661  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  54.47 
 
 
688 aa  664  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.66 
 
 
689 aa  650  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  50.37 
 
 
690 aa  653  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  50.22 
 
 
689 aa  660  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4167  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.22 
 
 
689 aa  652  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.22 
 
 
689 aa  661  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.51 
 
 
684 aa  640  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.22 
 
 
689 aa  660  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0023  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.8 
 
 
689 aa  662  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3782  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.8 
 
 
689 aa  662  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.22 
 
 
689 aa  659  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.95 
 
 
689 aa  659  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118047  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.36 
 
 
689 aa  661  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.22 
 
 
689 aa  660  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.42 
 
 
692 aa  640  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4130  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.8 
 
 
689 aa  662  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.22 
 
 
689 aa  649  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.22 
 
 
689 aa  649  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.36 
 
 
689 aa  651  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3868  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.22 
 
 
689 aa  649  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.22 
 
 
689 aa  650  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  52.9 
 
 
690 aa  747  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2574  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  56.01 
 
 
693 aa  654  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568144 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  53.33 
 
 
691 aa  703  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.16 
 
 
688 aa  663  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  54.64 
 
 
693 aa  677  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2051  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  50.22 
 
 
692 aa  637  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.22 
 
 
689 aa  653  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  50.22 
 
 
689 aa  660  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  50.22 
 
 
689 aa  660  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.42 
 
 
694 aa  632  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.6 
 
 
688 aa  633  1e-180  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.46 
 
 
694 aa  635  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.62 
 
 
684 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.81 
 
 
689 aa  630  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.32 
 
 
688 aa  628  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.39 
 
 
689 aa  627  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.47 
 
 
683 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  2.35888e-11 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.62 
 
 
684 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  5.38802e-07 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.18 
 
 
683 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  2.90731e-10 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.34 
 
 
685 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.37 
 
 
689 aa  618  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  6.39104e-08 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.16 
 
 
684 aa  617  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.04 
 
 
697 aa  614  1e-174  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.2 
 
 
684 aa  613  1e-174  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.08 
 
 
697 aa  610  1e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.35855  normal  0.503298 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.31 
 
 
684 aa  611  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0025  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  48.25 
 
 
689 aa  611  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0144037 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.37 
 
 
689 aa  608  1e-172  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.87 
 
 
684 aa  606  1e-172  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46.59 
 
 
694 aa  601  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.829353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.51 
 
 
689 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.45 
 
 
685 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.22 
 
 
689 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.08 
 
 
689 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  4.99537e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.08 
 
 
689 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002000  glycyl-tRNA synthetase beta chain  47.15 
 
 
688 aa  590  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.81 
 
 
688 aa  591  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1773  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.41 
 
 
697 aa  590  1e-167  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0663369  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2499  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46.72 
 
 
688 aa  588  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  46.96 
 
 
693 aa  584  1e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.38 
 
 
692 aa  584  1e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1803  glycyl-tRNA synthetase beta chain  45.55 
 
 
688 aa  576  1e-163  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.08 
 
 
688 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  1.20926e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.08 
 
 
688 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0016  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.37 
 
 
688 aa  572  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  3.27788e-08 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1804  glycyl-tRNA synthetase beta chain  45.11 
 
 
688 aa  567  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.06 
 
 
722 aa  538  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.40504  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0889  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.06 
 
 
722 aa  538  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0160  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.19 
 
 
699 aa  529  1e-149  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3982  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.82 
 
 
691 aa  523  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.295232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03829  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.12 
 
 
745 aa  522  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0686  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.18 
 
 
699 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509477  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0405  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.74 
 
 
699 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.721596  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3535  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  43.44 
 
 
712 aa  516  1e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.028288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  43.6 
 
 
700 aa  506  1e-142  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0415  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.73 
 
 
697 aa  508  1e-142  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474954  normal  0.979484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0400  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.73 
 
 
697 aa  508  1e-142  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.543468 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2210  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  44.06 
 
 
694 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.237877 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2581  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  44.06 
 
 
694 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.595681  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.03 
 
 
699 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454838  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1864  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.13 
 
 
712 aa  496  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0544  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  42.64 
 
 
720 aa  493  1e-138  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0446  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.39 
 
 
707 aa  494  1e-138  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1289  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  43.84 
 
 
704 aa  494  1e-138  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.708462 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.04 
 
 
687 aa  494  1e-138  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0550  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.87 
 
 
739 aa  495  1e-138  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0444  glycine--tRNA ligase  42.96 
 
 
711 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906989  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0524  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.59 
 
 
697 aa  491  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0189981 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.39 
 
 
687 aa  486  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>