264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0889 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0889  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  100 
 
 		 722 aa  1466    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  99.45 
 
 		 722 aa  1459    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.40504  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03829  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  65.29 
 
 		 745 aa  939    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3982  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  66.48 
 
 		 691 aa  906    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.295232 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  45.71 
 
 		 696 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2051  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  45.09 
 
 		 692 aa  567  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  43.91 
 
 		 691 aa  555  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.72 
 
 		 685 aa  557  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.96 
 
 		 690 aa  554  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.64 
 
 		 684 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.56 
 
 		 684 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.79 
 
 		 684 aa  547  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.36 
 
 		 684 aa  545  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  42.86 
 
 		 684 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.58 
 
 		 684 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.98 
 
 		 683 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.16 
 
 		 683 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  45.06 
 
 		 693 aa  538  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.18 
 
 		 685 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.59 
 
 		 684 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.32 
 
 		 688 aa  519  1e-146  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  40.39 
 
 		 690 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.58 
 
 		 689 aa  505  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3868  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.58 
 
 		 689 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.89 
 
 		 689 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.58 
 
 		 689 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.58 
 
 		 689 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.72 
 
 		 692 aa  503  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.89 
 
 		 689 aa  502  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.58 
 
 		 689 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.05 
 
 		 689 aa  502  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.05 
 
 		 689 aa  502  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  42.94 
 
 		 693 aa  499  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.89 
 
 		 689 aa  501  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  40.05 
 
 		 689 aa  502  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.05 
 
 		 689 aa  502  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.05 
 
 		 689 aa  502  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.26 
 
 		 688 aa  501  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.3 
 
 		 689 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.03 
 
 		 689 aa  498  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.61 
 
 		 689 aa  498  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4167  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.75 
 
 		 689 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.75 
 
 		 689 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.82 
 
 		 693 aa  490  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.24 
 
 		 688 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.14 
 
 		 689 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.02 
 
 		 689 aa  488  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.74 
 
 		 689 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.17 
 
 		 688 aa  484  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.92 
 
 		 694 aa  484  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0023  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.78 
 
 		 689 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4130  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.78 
 
 		 689 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3782  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.78 
 
 		 689 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.74 
 
 		 697 aa  479  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.11 
 
 		 689 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.28 
 
 		 689 aa  475  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.89 
 
 		 694 aa  475  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0025  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.28 
 
 		 689 aa  472  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0144037 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1803  glycyl-tRNA synthetase beta chain  38.56 
 
 		 688 aa  470  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1804  glycyl-tRNA synthetase beta chain  38.71 
 
 		 688 aa  469  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.97 
 
 		 689 aa  472  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2574  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  42.88 
 
 		 693 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568144 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.97 
 
 		 692 aa  471  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.88 
 
 		 689 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40 
 
 		 689 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1221  glycine--tRNA ligase  40.22 
 
 		 696 aa  469  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.2 
 
 		 688 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.86 
 
 		 689 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000499537 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.02 
 
 		 689 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000639104 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.85 
 
 		 692 aa  466  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.86 
 
 		 689 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.75 
 
 		 694 aa  463  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.829353  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.26 
 
 		 697 aa  462  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.35855  normal  0.503298 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.28 
 
 		 688 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000120926 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.28 
 
 		 688 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0016  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.42 
 
 		 688 aa  458  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000327788 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1773  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.26 
 
 		 697 aa  449  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0663369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.69 
 
 		 688 aa  452  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2499  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.53 
 
 		 688 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002000  glycyl-tRNA synthetase beta chain  39.11 
 
 		 688 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0686  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.25 
 
 		 699 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0550  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.13 
 
 		 739 aa  437  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.97 
 
 		 693 aa  436  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0544  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.97 
 
 		 720 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1289  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.25 
 
 		 704 aa  432  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708462 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4202  glycine--tRNA ligase  41.42 
 
 		 731 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3535  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.46 
 
 		 712 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.028288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.24 
 
 		 705 aa  425  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1864  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.27 
 
 		 712 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1568  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.24 
 
 		 712 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.269615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0584  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.95 
 
 		 699 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.83 
 
 		 699 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454838  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0218  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.97 
 
 		 699 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.97 
 
 		 699 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.59966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0701  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.97 
 
 		 699 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2430  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.97 
 
 		 699 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4177  glycine--tRNA ligase  39.27 
 
 		 708 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.787875  normal  0.54331 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0444  glycine--tRNA ligase  39.05 
 
 		 711 aa  419  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0528  glycine--tRNA ligase  38.1 
 
 		 720 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0942391 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2728  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.97 
 
 		 699 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>