More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0841 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  64.09 
 
 		 790 aa  653    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  58.79 
 
 		 647 aa  747    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  69.42 
 
 		 710 aa  711    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  63.42 
 
 		 778 aa  667    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  68.85 
 
 		 552 aa  780    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  100 
 
 		 608 aa  1255    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  59.92 
 
 		 793 aa  634  1e-180  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  60.91 
 
 		 763 aa  610  1e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  58.66 
 
 		 725 aa  596  1e-169  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  59.07 
 
 		 677 aa  570  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  52.66 
 
 		 783 aa  508  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  44.95 
 
 		 636 aa  504  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  45.3 
 
 		 569 aa  491  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  51.84 
 
 		 787 aa  485  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  52.64 
 
 		 829 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  45.45 
 
 		 675 aa  482  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  52.41 
 
 		 794 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  51.44 
 
 		 793 aa  476  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  43 
 
 		 580 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  41.98 
 
 		 583 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  47.78 
 
 		 680 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  39.88 
 
 		 611 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  41.41 
 
 		 586 aa  430  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  46.68 
 
 		 676 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  46.68 
 
 		 676 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  40.55 
 
 		 589 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  39.8 
 
 		 592 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  40.52 
 
 		 587 aa  411  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  43.81 
 
 		 673 aa  408  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  39.5 
 
 		 607 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  43.54 
 
 		 661 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  42.66 
 
 		 659 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  42.77 
 
 		 661 aa  382  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  42.43 
 
 		 661 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  42.45 
 
 		 658 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  41.78 
 
 		 708 aa  375  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  41.85 
 
 		 655 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  41.14 
 
 		 683 aa  365  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  38.75 
 
 		 728 aa  363  6e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  39.55 
 
 		 670 aa  359  6e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  41.44 
 
 		 673 aa  356  7.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  35.64 
 
 		 644 aa  355  1e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  38.52 
 
 		 725 aa  353  4e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.08 
 
 		 676 aa  351  3e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.16 
 
 		 663 aa  345  1e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  38.55 
 
 		 806 aa  345  2e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  39.53 
 
 		 686 aa  343  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  38.36 
 
 		 777 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  39.33 
 
 		 661 aa  332  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  34.56 
 
 		 799 aa  330  7e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  37.77 
 
 		 709 aa  328  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  36.86 
 
 		 675 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  34.32 
 
 		 659 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  35.28 
 
 		 675 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  35.35 
 
 		 691 aa  280  6e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1213  type I restriction-modification system specificity subunit  64.25 
 
 		 196 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  36.57 
 
 		 316 aa  200  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  29.53 
 
 		 697 aa  172  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  52.41 
 
 		 371 aa  165  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  27.84 
 
 		 587 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  32.69 
 
 		 498 aa  130  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  34.29 
 
 		 496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  27.9 
 
 		 574 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  26.56 
 
 		 574 aa  128  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  27.13 
 
 		 574 aa  127  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  27.62 
 
 		 505 aa  127  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.58 
 
 		 497 aa  124  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  24.81 
 
 		 527 aa  123  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  26 
 
 		 822 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  24.74 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  24.61 
 
 		 510 aa  122  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  31.84 
 
 		 510 aa  120  6e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  25.75 
 
 		 520 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  25.75 
 
 		 520 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  27.31 
 
 		 585 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0697  N-6 DNA methylase  28.85 
 
 		 530 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1594  N-6 DNA methylase  28.85 
 
 		 530 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.153041  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  23.59 
 
 		 511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  31.43 
 
 		 633 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  24.42 
 
 		 522 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  31.76 
 
 		 504 aa  117  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  31.94 
 
 		 505 aa  117  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  27.31 
 
 		 523 aa  117  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  27.31 
 
 		 508 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  25.1 
 
 		 522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  32.27 
 
 		 498 aa  115  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  24.95 
 
 		 547 aa  115  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  32.95 
 
 		 500 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 522 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  24.15 
 
 		 511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  25.37 
 
 		 523 aa  111  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  25.84 
 
 		 495 aa  110  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  23.87 
 
 		 544 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  25.25 
 
 		 516 aa  108  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  27.12 
 
 		 539 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  30.39 
 
 		 517 aa  107  6e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  24.26 
 
 		 529 aa  106  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  24.29 
 
 		 516 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  27.79 
 
 		 799 aa  106  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  24.9 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>