166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5238 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 173 aa  339  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  98.27 
 
 		 173 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  98.27 
 
 		 173 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  65.9 
 
 		 187 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  64.37 
 
 		 175 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  49.1 
 
 		 187 aa  121  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  41.04 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  41.59 
 
 		 172 aa  91.7  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  31.49 
 
 		 184 aa  87.8  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  47.47 
 
 		 196 aa  84  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 204 aa  84  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 185 aa  84  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 196 aa  84  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  47.47 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  32.52 
 
 		 190 aa  80.9  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 194 aa  77.4  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4271  PadR-like family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0469605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  38.16 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  30.94 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  35.43 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  42 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0979  transcriptional regulator PadR family protein  31.97 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0916  PadR-like family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  41.57 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  41.57 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  42.7 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3673  PadR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  33.65 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  38.3 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  37.78 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  27.86 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  42.5 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  35.79 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  31.2 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  31.2 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  38.75 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5591  PadR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0288  PadR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0298  PadR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0279  PadR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5605  PadR-like family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0554701  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  36.47 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  33.33 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1362  transcriptional regulator, PadR-like family  35.06 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323106  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07680  predicted transcriptional regulator  30.91 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  27 
 
 		 305 aa  58.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2867  PadR-like family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6303  transcriptional regulator, PadR-like family  37.62 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113883  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  32.67 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  33.85 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0943  transcriptional regulator, PadR-like family  31.87 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2505  Transcriptional regulator PadR-like protein  38.24 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.774349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  35.11 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  24.8 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  36.54 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0615  PadR-like family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4568  PadR-like family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1864  hypothetical protein  30.77 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00461724  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  31.97 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  39.39 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  29.14 
 
 		 197 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  35.78 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  34.41 
 
 		 242 aa  52.4  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  41.1 
 
 		 217 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  31.9 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  20.5 
 
 		 183 aa  51.2  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  32.22 
 
 		 202 aa  51.2  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  32.69 
 
 		 174 aa  51.2  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 200 aa  50.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  31.72 
 
 		 175 aa  50.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  35.16 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1562  transcriptional regulator, PadR-like family  29.91 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 		 250 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 226 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 226 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 226 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 230 aa  48.9  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1327  PadR-like family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00110327  decreased coverage  0.00407043 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  37.84 
 
 		 277 aa  48.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>