153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1792 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  99.74 
 
 
390 aa  764    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  99.74 
 
 
390 aa  764    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  766    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  73.08 
 
 
388 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  71.03 
 
 
388 aa  544  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  51.76 
 
 
390 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  53.87 
 
 
395 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  50.13 
 
 
388 aa  363  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  54.68 
 
 
387 aa  362  8e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  54.55 
 
 
390 aa  362  9e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  49.63 
 
 
395 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  49.87 
 
 
390 aa  355  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  53.67 
 
 
387 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  51.52 
 
 
393 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  49.75 
 
 
390 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  48.88 
 
 
410 aa  351  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  49.49 
 
 
390 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  49.49 
 
 
390 aa  349  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  49.37 
 
 
390 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  49.12 
 
 
390 aa  348  8e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  52.02 
 
 
385 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  49.12 
 
 
390 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  47.74 
 
 
393 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  50.13 
 
 
388 aa  345  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  48.87 
 
 
390 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  50.25 
 
 
392 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  51.13 
 
 
393 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  48.24 
 
 
393 aa  342  9e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  49.62 
 
 
386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  48.98 
 
 
386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  50 
 
 
436 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  50 
 
 
436 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  50 
 
 
436 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  50 
 
 
436 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  50 
 
 
392 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  50 
 
 
392 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  50 
 
 
392 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  52.78 
 
 
392 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  51.14 
 
 
386 aa  322  9.000000000000001e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  51.99 
 
 
392 aa  319  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  53.28 
 
 
385 aa  318  9e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  49.23 
 
 
387 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  49.49 
 
 
387 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  48.59 
 
 
387 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  49.37 
 
 
388 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  51.13 
 
 
391 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  51.13 
 
 
391 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  50.76 
 
 
391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  50.63 
 
 
391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  50.76 
 
 
391 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  50.13 
 
 
391 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  39.69 
 
 
367 aa  239  5e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  37.93 
 
 
365 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  38.48 
 
 
362 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  38.66 
 
 
384 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  40.26 
 
 
361 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  37.43 
 
 
385 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  40.34 
 
 
385 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  36.02 
 
 
410 aa  170  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  35.13 
 
 
382 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  28.18 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  28.53 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  29.01 
 
 
382 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  29.01 
 
 
382 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  27.75 
 
 
378 aa  112  9e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  26.39 
 
 
368 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  27.95 
 
 
369 aa  97.1  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  27.86 
 
 
370 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  24.59 
 
 
378 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  26.23 
 
 
397 aa  94  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  24.23 
 
 
367 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  24.23 
 
 
367 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  32 
 
 
378 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  28.01 
 
 
409 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  26.47 
 
 
395 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  27.89 
 
 
398 aa  90.1  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  25.45 
 
 
430 aa  89.7  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  27.03 
 
 
395 aa  89.7  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  27 
 
 
386 aa  89.7  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  25.41 
 
 
394 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  26.08 
 
 
395 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  25.14 
 
 
393 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  25.52 
 
 
399 aa  86.7  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  25.39 
 
 
411 aa  86.3  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  24.53 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  25.99 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  28.21 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  23.43 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  23.98 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  23.27 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  22.71 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  25.71 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  22.64 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  23.86 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  31.03 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  23.2 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1049  hypothetical protein  64.91 
 
 
84 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  26.01 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  32.58 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  24.02 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>