More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1980 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1980  ABC transporter related  100 
 
 
355 aa  720    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0256  ABC transporter-related protein  54.05 
 
 
349 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  50.29 
 
 
351 aa  347  2e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  50.57 
 
 
348 aa  345  7e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1582  ABC transporter related  49.14 
 
 
361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  43.06 
 
 
347 aa  298  7e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0922  ABC transporter related  38.51 
 
 
353 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1403  ABC transporter related protein  40.11 
 
 
351 aa  256  4e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.579406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 
353 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1022  ABC transporter related  38.51 
 
 
353 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2784  ABC-type transporter, ATPase component  38.76 
 
 
383 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000307726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1759  ABC transporter related  38.22 
 
 
353 aa  252  6e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  40 
 
 
355 aa  248  9e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1819  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.05 
 
 
353 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147813  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.03 
 
 
386 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  35.47 
 
 
386 aa  225  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.57 
 
 
386 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.08 
 
 
372 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.85 
 
 
390 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0642  ABC transporter related protein  41.52 
 
 
342 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1525  ABC transporter related  40.78 
 
 
367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.571493  hitchhiker  0.00153278 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.47 
 
 
386 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  35.47 
 
 
386 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.47 
 
 
386 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7682  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  36.93 
 
 
379 aa  222  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.3686 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1447  ABC transporter related  43.38 
 
 
367 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  36.01 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1300  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 
378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2309  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2277  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1057  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 
386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2178  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.455758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1787  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 
386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0108  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 
386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432666  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  44.4 
 
 
335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  39.71 
 
 
367 aa  219  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.08 
 
 
370 aa  219  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2122  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 
386 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.65 
 
 
384 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1152  ABC transporter related  48.92 
 
 
312 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 
384 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0387  ABC transporter related  39.81 
 
 
367 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0057  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  49.35 
 
 
312 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.72588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2019  putrescine ABC transport system, ATP-binding protein  36.42 
 
 
384 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.1 
 
 
359 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  35 
 
 
388 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 
384 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.01 
 
 
372 aa  217  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 
384 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0725  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.42 
 
 
384 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0633  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.42 
 
 
384 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  42.74 
 
 
527 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.1 
 
 
400 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.57 
 
 
387 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  35.63 
 
 
345 aa  216  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6346  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  36.65 
 
 
384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2147  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.42 
 
 
371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0301  ABC transporter related  37.6 
 
 
386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2813  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  36.65 
 
 
384 aa  215  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0370  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.57 
 
 
371 aa  215  8e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1949  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 
384 aa  215  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.415824  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.36 
 
 
388 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.91 
 
 
380 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2476  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.22 
 
 
377 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.615862  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  35.19 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.98 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  38.85 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.95 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.85 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  34.82 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  40.81 
 
 
381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3044  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.51 
 
 
384 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.61 
 
 
367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.51 
 
 
388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.01 
 
 
360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.01 
 
 
378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  34.82 
 
 
377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3522  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.76 
 
 
384 aa  213  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.185536 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 
343 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6066  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.51 
 
 
381 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.61 
 
 
355 aa  212  7.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.72 
 
 
377 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.9 
 
 
377 aa  212  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.9 
 
 
377 aa  212  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  36.36 
 
 
366 aa  212  9e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1263  putrescine transport ATP-binding protein PotG  35.78 
 
 
381 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  35.9 
 
 
377 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.9 
 
 
377 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  34.21 
 
 
375 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.9 
 
 
377 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  35.17 
 
 
375 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  37.66 
 
 
352 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.96 
 
 
378 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  39.14 
 
 
358 aa  211  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.9 
 
 
377 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  35.9 
 
 
377 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1862  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.05 
 
 
371 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  36.84 
 
 
379 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0927  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.9 
 
 
377 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>