More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2471 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  43.27 
 
 		 928 aa  715    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  43.27 
 
 		 928 aa  715    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  40.42 
 
 		 930 aa  685    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  54.41 
 
 		 1020 aa  1024    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  42.36 
 
 		 939 aa  691    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  55.18 
 
 		 937 aa  698    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  42.98 
 
 		 928 aa  709    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  54.88 
 
 		 937 aa  695    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  38.66 
 
 		 936 aa  648    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  56.18 
 
 		 979 aa  1073    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  54.01 
 
 		 1025 aa  1034    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  43.27 
 
 		 928 aa  715    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  43.27 
 
 		 928 aa  715    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  55.78 
 
 		 999 aa  1041    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  85.4 
 
 		 1060 aa  1775    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  56.61 
 
 		 932 aa  693    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  59.49 
 
 		 973 aa  719    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  55.36 
 
 		 1004 aa  1035    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  55.91 
 
 		 978 aa  1072    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  59.13 
 
 		 1043 aa  1182    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  55.89 
 
 		 976 aa  1068    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  54.79 
 
 		 1010 aa  1048    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  38.34 
 
 		 930 aa  669    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1542  DNA polymerase I  39.52 
 
 		 940 aa  652    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  96.66 
 
 		 1047 aa  2053    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  55.03 
 
 		 937 aa  695    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  43.27 
 
 		 928 aa  715    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1391  DNA polymerase I  58.48 
 
 		 1013 aa  1158    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.413806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4423  DNA polymerase I  54.73 
 
 		 1016 aa  1026    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  61.04 
 
 		 1000 aa  1217    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  39.16 
 
 		 939 aa  688    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  41.17 
 
 		 934 aa  707    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  57.01 
 
 		 941 aa  685    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1841  DNA polymerase I  39.58 
 
 		 936 aa  649    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721717  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  39.81 
 
 		 943 aa  666    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  54.62 
 
 		 1032 aa  1038    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  47.34 
 
 		 945 aa  820    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  56.28 
 
 		 929 aa  659    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  38.83 
 
 		 957 aa  642    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  54.89 
 
 		 1021 aa  1046    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  43.27 
 
 		 928 aa  715    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1729  DNA polymerase I  39.64 
 
 		 944 aa  662    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  39.98 
 
 		 947 aa  638    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  54.81 
 
 		 1033 aa  1052    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  41.35 
 
 		 924 aa  681    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  55.28 
 
 		 1014 aa  1023    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  40.41 
 
 		 942 aa  663    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  57.58 
 
 		 935 aa  696    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0625  DNA polymerase I  45.91 
 
 		 937 aa  789    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.480617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  100 
 
 		 1047 aa  2124    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  54.82 
 
 		 978 aa  1055    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  56.23 
 
 		 940 aa  666    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  43.27 
 
 		 928 aa  715    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  57.6 
 
 		 943 aa  675    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0678  DNA polymerase I  78.3 
 
 		 1016 aa  1583    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80797  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  58.69 
 
 		 928 aa  782    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  43.27 
 
 		 928 aa  715    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2694  DNA polymerase I  99.9 
 
 		 1047 aa  2122    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  54.59 
 
 		 992 aa  1045    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  50.48 
 
 		 968 aa  977    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  52.99 
 
 		 979 aa  1040    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1501  DNA polymerase I  78.8 
 
 		 1024 aa  1632    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1478  DNA polymerase I  40.27 
 
 		 941 aa  662    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.495398 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  55.14 
 
 		 915 aa  631  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  37.82 
 
 		 956 aa  622  1e-177  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  38.32 
 
 		 963 aa  624  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0543  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 1024 aa  615  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72991  normal  0.283494 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  53.65 
 
 		 924 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  37.9 
 
 		 939 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  35.57 
 
 		 956 aa  600  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  37.61 
 
 		 936 aa  598  1e-169  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  36.27 
 
 		 939 aa  597  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  36.34 
 
 		 950 aa  594  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  36.16 
 
 		 949 aa  595  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  48.55 
 
 		 929 aa  580  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  48.03 
 
 		 928 aa  580  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  50.56 
 
 		 908 aa  581  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  47.1 
 
 		 951 aa  580  1e-164  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  34.64 
 
 		 932 aa  578  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  37.03 
 
 		 946 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  36.97 
 
 		 936 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  49.36 
 
 		 931 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  49.2 
 
 		 933 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  48.25 
 
 		 929 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  47.52 
 
 		 916 aa  575  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  49.28 
 
 		 912 aa  574  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  36.98 
 
 		 945 aa  572  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  35.28 
 
 		 944 aa  571  1e-161  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  48.78 
 
 		 928 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  49.76 
 
 		 913 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  48.78 
 
 		 928 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  48.78 
 
 		 928 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  48.45 
 
 		 915 aa  569  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  47.67 
 
 		 926 aa  567  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  48.78 
 
 		 928 aa  569  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  48.22 
 
 		 931 aa  568  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  48.78 
 
 		 928 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  48.06 
 
 		 934 aa  569  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  49.52 
 
 		 903 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  47.79 
 
 		 932 aa  564  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>