More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3581 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  42.04 
 
 		 1156 aa  748    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3377  double-strand break repair helicase AddA  41.36 
 
 		 1165 aa  660    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.291395  normal  0.767589 
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  53.94 
 
 		 1180 aa  1130    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  39.56 
 
 		 1161 aa  708    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  48.13 
 
 		 1182 aa  949    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  48.52 
 
 		 1183 aa  953    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  52.77 
 
 		 1180 aa  1105    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  54.02 
 
 		 1180 aa  1132    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  39.64 
 
 		 1202 aa  663    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  41.53 
 
 		 1151 aa  665    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  43.15 
 
 		 1155 aa  899    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  39.62 
 
 		 1187 aa  677    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  47.79 
 
 		 1189 aa  888    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  40.44 
 
 		 1161 aa  672    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  38.94 
 
 		 1164 aa  673    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  41.09 
 
 		 1159 aa  725    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  42.36 
 
 		 1156 aa  768    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  38.52 
 
 		 1162 aa  648    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  100 
 
 		 1177 aa  2348    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  48.52 
 
 		 1183 aa  944    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3300  double-strand break repair helicase AddA  41.23 
 
 		 1167 aa  634  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  39.34 
 
 		 1164 aa  633  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  39.73 
 
 		 1157 aa  621  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1610  double-strand break repair helicase AddA  39.5 
 
 		 1157 aa  602  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  39.3 
 
 		 1147 aa  597  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  38.07 
 
 		 1183 aa  589  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4904  double-strand break repair helicase AddA  38.41 
 
 		 1147 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.921527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4440  double-strand break repair helicase AddA  38.32 
 
 		 1147 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.548671  normal  0.292809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  36 
 
 		 1125 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0489  double-strand break repair helicase AddA  39.47 
 
 		 1157 aa  571  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127792  hitchhiker  0.00205602 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  36.44 
 
 		 1185 aa  543  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  35.98 
 
 		 1119 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  33.97 
 
 		 1121 aa  505  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  34.97 
 
 		 1124 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2681  double-strand break repair helicase AddA  35.82 
 
 		 1142 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  34.94 
 
 		 1161 aa  487  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  34.94 
 
 		 1166 aa  476  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  30.3 
 
 		 1089 aa  462  9.999999999999999e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  37.73 
 
 		 1106 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  37.62 
 
 		 1106 aa  426  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  29.21 
 
 		 854 aa  419  9.999999999999999e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1455  UvrD-like DNA helicase, C terminal  37.36 
 
 		 1157 aa  406  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.719405  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  36.01 
 
 		 1120 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  31.51 
 
 		 1147 aa  336  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.67 
 
 		 860 aa  313  2e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  27.95 
 
 		 1173 aa  234  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1177 aa  228  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  29.51 
 
 		 1089 aa  219  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  28.7 
 
 		 1173 aa  219  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  27.06 
 
 		 1101 aa  206  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28.62 
 
 		 1197 aa  205  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  24.64 
 
 		 1185 aa  193  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1057 aa  193  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  24.26 
 
 		 1173 aa  192  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  27.94 
 
 		 1168 aa  189  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  25.29 
 
 		 1149 aa  182  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0467  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24 
 
 		 907 aa  179  3e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  27.65 
 
 		 1162 aa  169  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  30.8 
 
 		 1101 aa  159  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.42 
 
 		 1186 aa  159  4e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1285  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.53 
 
 		 1086 aa  157  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.100578 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  25.87 
 
 		 1095 aa  155  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  23.78 
 
 		 1121 aa  152  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  26.41 
 
 		 1226 aa  152  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  23.95 
 
 		 1270 aa  151  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  26.15 
 
 		 1117 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  23.26 
 
 		 1248 aa  142  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  26.79 
 
 		 1047 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  29.33 
 
 		 1080 aa  139  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  28.3 
 
 		 705 aa  137  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  26.56 
 
 		 1146 aa  136  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  27.46 
 
 		 1110 aa  132  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.43 
 
 		 1139 aa  132  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2896  UvrD/REP helicase  29.46 
 
 		 1165 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1061 aa  129  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0910  putative recombination protein RecB  23.82 
 
 		 933 aa  128  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.646697  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1248  Exodeoxyribonuclease V  28.06 
 
 		 833 aa  127  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  28.93 
 
 		 1087 aa  127  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  28.69 
 
 		 1187 aa  126  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.13 
 
 		 1251 aa  124  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  25.62 
 
 		 1118 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1697  UvrD/REP helicase  25.41 
 
 		 1182 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1910  UvrD/REP helicase  27.61 
 
 		 907 aa  120  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.22 
 
 		 756 aa  119  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1981  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.41 
 
 		 1259 aa  119  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.335433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2005  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.6 
 
 		 1155 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.77 
 
 		 732 aa  115  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.52 
 
 		 725 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  25.26 
 
 		 921 aa  114  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.92 
 
 		 1271 aa  114  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.44 
 
 		 742 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  23.75 
 
 		 1110 aa  113  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2193  UvrD/REP helicase  32 
 
 		 1103 aa  113  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1986  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.96 
 
 		 1209 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259297  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  25.39 
 
 		 1282 aa  112  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1561  UvrD/REP helicase  23.2 
 
 		 1054 aa  112  4.0000000000000004e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  27.24 
 
 		 787 aa  112  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  23.97 
 
 		 1110 aa  112  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  22.24 
 
 		 1377 aa  111  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  22.19 
 
 		 1217 aa  110  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>