119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3421 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  100 
 
 		 466 aa  905    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  48.7 
 
 		 463 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  49.89 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  51.33 
 
 		 467 aa  415  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  48.34 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  48.28 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  49.12 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  49.1 
 
 		 443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  48.58 
 
 		 465 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  49.34 
 
 		 466 aa  391  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  47.52 
 
 		 465 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  48.49 
 
 		 456 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  44.87 
 
 		 469 aa  355  8.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  43.08 
 
 		 462 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 462 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  45.7 
 
 		 460 aa  347  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  45.41 
 
 		 455 aa  342  5.999999999999999e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  47.64 
 
 		 456 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  47.64 
 
 		 456 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  42.98 
 
 		 493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  43.1 
 
 		 440 aa  316  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  42.59 
 
 		 463 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  38.55 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  38.33 
 
 		 460 aa  273  4.0000000000000004e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  36.08 
 
 		 424 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  36.9 
 
 		 435 aa  263  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 492 aa  262  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  35.35 
 
 		 424 aa  260  4e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  37.61 
 
 		 451 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 429 aa  231  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  37.64 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 426 aa  193  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 		 456 aa  192  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4202  hypothetical protein  31.32 
 
 		 479 aa  183  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 		 419 aa  177  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 421 aa  173  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  30.33 
 
 		 425 aa  167  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 467 aa  163  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 416 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  34.12 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 445 aa  156  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  30.04 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 440 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  29.04 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  30.77 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 447 aa  150  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  33.95 
 
 		 440 aa  150  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 467 aa  148  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 449 aa  146  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 460 aa  144  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 441 aa  141  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 		 468 aa  140  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  28.36 
 
 		 430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  27.25 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 469 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 421 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  28.54 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  27.75 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  24.94 
 
 		 425 aa  106  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  28.45 
 
 		 451 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  27.16 
 
 		 448 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 436 aa  100  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  28.14 
 
 		 446 aa  99  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  25.33 
 
 		 474 aa  99  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  23.54 
 
 		 408 aa  98.2  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 454 aa  97.8  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  23.11 
 
 		 437 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  24.11 
 
 		 427 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  24.26 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 442 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 		 439 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 437 aa  93.6  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  20.68 
 
 		 430 aa  93.6  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  23.88 
 
 		 427 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 427 aa  93.6  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  27 
 
 		 460 aa  92.8  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12428  hypothetical protein  24.42 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0597064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  24 
 
 		 427 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  22.74 
 
 		 435 aa  90.1  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 427 aa  90.1  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 449 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  23.56 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  23.44 
 
 		 427 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  23.44 
 
 		 427 aa  87.4  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  23.44 
 
 		 427 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  23.44 
 
 		 427 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  23.44 
 
 		 427 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>