More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1502 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  100 
 
 
360 aa  739    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  67.82 
 
 
363 aa  482  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  54.62 
 
 
365 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  54.52 
 
 
360 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  52.37 
 
 
365 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  51.93 
 
 
363 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  48.14 
 
 
356 aa  345  6e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  47.85 
 
 
356 aa  345  8.999999999999999e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  46.94 
 
 
344 aa  340  2e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  51.01 
 
 
367 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  46.24 
 
 
360 aa  325  6e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  46.42 
 
 
355 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  46.42 
 
 
355 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  46.42 
 
 
355 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  47.52 
 
 
376 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  44.54 
 
 
353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  46.76 
 
 
380 aa  305  9.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  47.52 
 
 
360 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  47.79 
 
 
369 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  43.63 
 
 
356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  41.32 
 
 
366 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  33.53 
 
 
357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  34.2 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  33.24 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  31.71 
 
 
351 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  32.4 
 
 
351 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  31.62 
 
 
351 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  31.34 
 
 
351 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  34.77 
 
 
348 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  34.11 
 
 
359 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  35.35 
 
 
358 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  31.96 
 
 
351 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  29.13 
 
 
353 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  33.91 
 
 
348 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  31.79 
 
 
353 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
348 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  32.76 
 
 
360 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  35.95 
 
 
341 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  33.91 
 
 
348 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  32.12 
 
 
357 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  28.65 
 
 
353 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
353 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
357 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  30.26 
 
 
350 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  30.2 
 
 
351 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  30.96 
 
 
360 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  30.17 
 
 
348 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  31.14 
 
 
418 aa  133  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  31.16 
 
 
357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  30.73 
 
 
363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  30.03 
 
 
348 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  30.55 
 
 
343 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  30.29 
 
 
355 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  30.62 
 
 
362 aa  106  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  24.74 
 
 
416 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  31.2 
 
 
263 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
209 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 
274 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
246 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
256 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.78 
 
 
243 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  32 
 
 
285 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.78 
 
 
234 aa  61.2  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
275 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
261 aa  60.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  32.5 
 
 
399 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
272 aa  59.7  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.86 
 
 
264 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  26.03 
 
 
265 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 
209 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  38.53 
 
 
252 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  28.95 
 
 
205 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  28.71 
 
 
407 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30 
 
 
212 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4840  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531482  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 
249 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  29.63 
 
 
400 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  30.25 
 
 
400 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  30.67 
 
 
285 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  30.67 
 
 
285 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
249 aa  57  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  27.85 
 
 
411 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
402 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  29.82 
 
 
313 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.46 
 
 
262 aa  56.6  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  29.63 
 
 
400 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.31 
 
 
402 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  32.5 
 
 
246 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.41 
 
 
212 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2061  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.16 
 
 
236 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000216259  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2057  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.16 
 
 
236 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00373445  unclonable  0.00000000000181282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2288  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.16 
 
 
236 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434685  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  30.09 
 
 
263 aa  56.2  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  30.09 
 
 
263 aa  56.2  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  30.09 
 
 
263 aa  56.2  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2405  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.16 
 
 
236 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031453  unclonable  0.0000107222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>