More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0598 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0598  CheW protein  100 
 
 
211 aa  425  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5116  putative CheW protein  38.12 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119327  normal  0.0201164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  30.88 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  33.82 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  30.34 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3202  CheW protein  31.03 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  33.51 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  33.51 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  30.46 
 
 
325 aa  62  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1000  putative CheW protein  33.58 
 
 
182 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3255  CheW protein  30.77 
 
 
189 aa  61.6  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0912873  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  34.29 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  34.19 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  24.62 
 
 
344 aa  60.1  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1325  CheW protein  43.06 
 
 
161 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  34.82 
 
 
199 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  33.55 
 
 
185 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  38.27 
 
 
181 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  28 
 
 
444 aa  57  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  38.98 
 
 
162 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  25.32 
 
 
161 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  33.08 
 
 
157 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0329  CheW protein  29.71 
 
 
158 aa  55.5  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  44.44 
 
 
518 aa  54.7  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  40 
 
 
164 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  42.59 
 
 
180 aa  54.3  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  50 
 
 
164 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  37.5 
 
 
163 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  45.28 
 
 
181 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  45.45 
 
 
779 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  35 
 
 
146 aa  53.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  28.06 
 
 
159 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2380  CheW protein  28.24 
 
 
177 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  42.11 
 
 
163 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  42.42 
 
 
165 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  48.08 
 
 
173 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  35.19 
 
 
147 aa  52.8  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  26.12 
 
 
164 aa  52.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  35.19 
 
 
147 aa  52.8  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  41.51 
 
 
165 aa  52.8  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  27.59 
 
 
907 aa  52  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1430  hypothetical protein  44.23 
 
 
171 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  41.18 
 
 
166 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  32.1 
 
 
169 aa  52  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  30.68 
 
 
183 aa  52  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  26.53 
 
 
159 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  27.03 
 
 
146 aa  51.6  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  42.59 
 
 
158 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0468  putative CheW protein  32.18 
 
 
186 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0754564  normal  0.870958 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  42.59 
 
 
173 aa  51.6  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  41.51 
 
 
167 aa  51.6  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  35.19 
 
 
192 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  37.5 
 
 
163 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  26.12 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16440  hypothetical protein  44.23 
 
 
171 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910031  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  27.73 
 
 
159 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  25.85 
 
 
159 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  27.03 
 
 
146 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0588  CheW protein  35.19 
 
 
155 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0029274  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  38.81 
 
 
169 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  46.15 
 
 
164 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  40.74 
 
 
158 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  47.46 
 
 
179 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  38.89 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  39.34 
 
 
170 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  32.43 
 
 
174 aa  50.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  26.87 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  38.89 
 
 
159 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  42.62 
 
 
160 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  41.51 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  42.59 
 
 
164 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  44.23 
 
 
164 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  27.89 
 
 
159 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  35.59 
 
 
161 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2706  CheW protein  38.89 
 
 
155 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  30.99 
 
 
169 aa  50.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  46.15 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  22.39 
 
 
146 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  37.04 
 
 
162 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  40.74 
 
 
158 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  46.94 
 
 
166 aa  49.3  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  40.74 
 
 
158 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  40.74 
 
 
163 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  38.46 
 
 
168 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  45.1 
 
 
163 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  28.32 
 
 
331 aa  49.3  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.59 
 
 
159 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  29.17 
 
 
159 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  35.59 
 
 
159 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  35.59 
 
 
159 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  35.94 
 
 
165 aa  48.9  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  35.59 
 
 
159 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  35.94 
 
 
165 aa  48.9  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  38.89 
 
 
178 aa  48.9  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1838  CheW protein  26.72 
 
 
177 aa  48.9  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00299326 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  46.51 
 
 
165 aa  48.9  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  37.04 
 
 
183 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0090  CheW protein  33.33 
 
 
176 aa  48.9  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.37 
 
 
164 aa  48.5  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2031  CheW protein  31.16 
 
 
153 aa  48.5  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.505139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>