More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0366 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  62.79 
 
 		 270 aa  321  7e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  62.4 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  61.48 
 
 		 270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  58.73 
 
 		 285 aa  299  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  46.18 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  46.03 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 255 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  44.18 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  40.43 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2929  GntR domain-containing protein  45.74 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4351  GntR domain-containing protein  40.84 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1719  GntR domain-containing protein  42.97 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  hitchhiker  0.00929417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  40.32 
 
 		 255 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  40.32 
 
 		 255 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  40.32 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  38.82 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  43.15 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  39.75 
 
 		 261 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  40.52 
 
 		 254 aa  165  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  41.38 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  41.38 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  41.38 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  41.38 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  41.38 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  40.85 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  40.85 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  40.85 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  40.85 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  39.92 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  40.85 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  40.85 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  40.85 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  40.85 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  40.85 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  40.52 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  39.83 
 
 		 263 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  39.92 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  38.87 
 
 		 251 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  39.83 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  38.34 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  39.92 
 
 		 254 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  38.84 
 
 		 257 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  38.86 
 
 		 256 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  39.6 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  39.22 
 
 		 250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  39.22 
 
 		 250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  39.22 
 
 		 250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  39.22 
 
 		 250 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1035  transcriptional regulator PdhR  39.22 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.778574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3364  transcriptional regulator PdhR  39.22 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0485553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3492  transcriptional regulator PdhR  39.22 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.593618  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  38.93 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  35.65 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2160  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  37.45 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  38.68 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  38.46 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  38.79 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  40.36 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  38.36 
 
 		 250 aa  149  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  38.36 
 
 		 250 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  38.36 
 
 		 250 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  38.36 
 
 		 250 aa  149  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  38.79 
 
 		 254 aa  149  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  40.35 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  40.35 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  37.45 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  37.12 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  40.35 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  37.04 
 
 		 254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  40.35 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  40.35 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  38.46 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  40.35 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  38.79 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  40.35 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  40.36 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  39.91 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  39.46 
 
 		 258 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  39.46 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  39.46 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  39.46 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  36.63 
 
 		 250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  39.47 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  37.45 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  37.3 
 
 		 255 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4400  GntR domain-containing protein  43.23 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367956  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2626  transcriptional regulator PdhR  36.12 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  38.03 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>