More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2083 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  100 
 
 
270 aa  550  1e-156  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  74.44 
 
 
272 aa  421  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  69.63 
 
 
280 aa  395  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  72.59 
 
 
272 aa  387  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  67.41 
 
 
268 aa  368  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  53.14 
 
 
273 aa  314  1e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  53.14 
 
 
273 aa  313  3e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  53.87 
 
 
273 aa  308  8e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  52.4 
 
 
276 aa  301  7e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  53.56 
 
 
275 aa  301  8e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  53.14 
 
 
295 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  53.14 
 
 
296 aa  300  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  51.66 
 
 
275 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  52.21 
 
 
288 aa  298  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  53.51 
 
 
326 aa  298  7e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  52.4 
 
 
287 aa  297  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  50.74 
 
 
288 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  52.4 
 
 
280 aa  295  7e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  52.77 
 
 
284 aa  294  9e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  52.77 
 
 
289 aa  294  9e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  50.55 
 
 
276 aa  293  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  52.77 
 
 
324 aa  294  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  54.65 
 
 
299 aa  294  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  51.29 
 
 
275 aa  294  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1623  nitrogenase reductase  50.55 
 
 
275 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  52.03 
 
 
296 aa  293  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  50.55 
 
 
275 aa  292  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  50.74 
 
 
292 aa  292  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  52.81 
 
 
299 aa  292  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1803  nitrogenase reductase  48.9 
 
 
275 aa  292  5e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.736404  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  51.28 
 
 
274 aa  292  5e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  50.55 
 
 
275 aa  292  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  52.06 
 
 
272 aa  291  9e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0065  nitrogenase reductase  49.26 
 
 
275 aa  290  1e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0658  nitrogenase reductase  48.53 
 
 
275 aa  290  1e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0493156  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2364  nitrogenase iron protein  52.77 
 
 
298 aa  290  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  49.08 
 
 
275 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  51.1 
 
 
291 aa  289  4e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1813  nitrogenase iron protein  53.56 
 
 
296 aa  288  5e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1785  nitrogenase iron protein  53.56 
 
 
296 aa  288  5e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  48.53 
 
 
296 aa  288  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  50.74 
 
 
275 aa  288  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  49.26 
 
 
290 aa  286  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1218  nitrogenase iron protein  53.26 
 
 
288 aa  286  3e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  48.53 
 
 
293 aa  286  3e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  51.92 
 
 
296 aa  284  1e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  52.57 
 
 
299 aa  283  2e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  50.18 
 
 
324 aa  283  2e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  50.37 
 
 
292 aa  283  2e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.20216e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  50.19 
 
 
274 aa  282  3e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  53.46 
 
 
297 aa  283  3e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  50.37 
 
 
276 aa  283  3e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  3.68653e-05  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  50.56 
 
 
276 aa  282  3e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0098  nitrogenase reductase  47.79 
 
 
275 aa  282  4e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.380897  normal  0.0345089 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  49.27 
 
 
277 aa  282  5e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  51.1 
 
 
298 aa  281  8e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  51.72 
 
 
289 aa  281  9e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1434  nitrogenase iron protein  49.45 
 
 
283 aa  281  9e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  52.49 
 
 
288 aa  280  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  51.72 
 
 
289 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1430  nitrogenase reductase  52.24 
 
 
293 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  51.34 
 
 
288 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  51.34 
 
 
289 aa  279  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1073  nitrogenase reductase  51.47 
 
 
299 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  50.96 
 
 
289 aa  279  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0969  nitrogenase reductase  51.47 
 
 
299 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  50.37 
 
 
295 aa  278  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  51.15 
 
 
274 aa  278  5e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1240  nitrogenase reductase  51.1 
 
 
296 aa  278  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.118183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1522  nitrogenase reductase  51.1 
 
 
296 aa  278  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3996  nitrogenase reductase  51.47 
 
 
299 aa  278  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4463  nitrogenase reductase  51.1 
 
 
300 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  48.54 
 
 
276 aa  278  6e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  50.75 
 
 
293 aa  277  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  50.75 
 
 
303 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  50.74 
 
 
298 aa  276  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1465  nitrogenase reductase  51.12 
 
 
293 aa  275  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375574  hitchhiker  0.00132251 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  50.19 
 
 
289 aa  275  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  50 
 
 
274 aa  275  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0229  nitrogenase reductase  51.12 
 
 
293 aa  275  6e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2345  nitrogenase reductase  50.37 
 
 
296 aa  275  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.383855  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6225  nitrogenase reductase  50.74 
 
 
297 aa  275  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  50 
 
 
274 aa  274  1e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4136  nitrogenase iron protein subunit NifH  52.31 
 
 
296 aa  274  1e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0109879  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1010  nitrogenase reductase  50.37 
 
 
295 aa  273  2e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  50.76 
 
 
274 aa  273  3e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  2.40583e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5052  nitrogenase reductase  49.26 
 
 
295 aa  272  5e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  48.65 
 
 
290 aa  271  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0473  nitrogenase reductase  50.37 
 
 
290 aa  271  7e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7808  nitrogenase reductase  50.75 
 
 
293 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220892  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7753  nitrogenase reductase  50.75 
 
 
293 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73881  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  49.08 
 
 
291 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  48.53 
 
 
289 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5879  nitrogenase reductase  49.63 
 
 
295 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.897591 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3632  nitrogenase reductase  50.37 
 
 
293 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  50 
 
 
274 aa  269  3e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  50.38 
 
 
274 aa  270  3e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5925  nitrogenase reductase  49.63 
 
 
295 aa  270  3e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  50 
 
 
274 aa  269  4e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1038  nitrogenase iron protein subunit NifH  47.76 
 
 
264 aa  269  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000199125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>