More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0573 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  100 
 
 
422 aa  825    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  55.44 
 
 
414 aa  404  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  51.52 
 
 
417 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  50 
 
 
414 aa  348  1e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  49.14 
 
 
413 aa  344  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  51.24 
 
 
397 aa  330  3e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  46.33 
 
 
413 aa  316  6e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  46.08 
 
 
413 aa  315  9e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  44.91 
 
 
410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  43.12 
 
 
384 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  40.05 
 
 
417 aa  239  5e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  39.12 
 
 
405 aa  239  5.999999999999999e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  38.96 
 
 
411 aa  237  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  35.19 
 
 
433 aa  207  4e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  35.95 
 
 
404 aa  206  7e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  37.06 
 
 
436 aa  206  8e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1181  citrate transporter  35.95 
 
 
420 aa  203  5e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.355056 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  35.26 
 
 
421 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  33.65 
 
 
452 aa  194  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  31.71 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  32.07 
 
 
405 aa  152  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  33.59 
 
 
400 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  32.16 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  28.57 
 
 
419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  30.52 
 
 
414 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  31.58 
 
 
404 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  32.43 
 
 
429 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  32.89 
 
 
418 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  31.09 
 
 
401 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  29.1 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  32.88 
 
 
396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  31.89 
 
 
429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  32.62 
 
 
396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  31.52 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3536  citrate transporter  30.49 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  26.84 
 
 
426 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  30.2 
 
 
421 aa  110  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  27.25 
 
 
423 aa  108  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  26.49 
 
 
421 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  26.33 
 
 
427 aa  103  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  27.23 
 
 
408 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.94 
 
 
419 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  27.57 
 
 
440 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  26.55 
 
 
431 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  25.71 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  27.39 
 
 
427 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  25.06 
 
 
429 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2453  membrane anion transport protein  28.33 
 
 
413 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  26.54 
 
 
441 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  28.32 
 
 
424 aa  94.7  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  28.86 
 
 
423 aa  94.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  27.27 
 
 
441 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  24.74 
 
 
437 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  25.99 
 
 
441 aa  94.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  24.74 
 
 
437 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  24.24 
 
 
429 aa  94  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  26.96 
 
 
428 aa  94  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  26.17 
 
 
437 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  24.49 
 
 
451 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  27.51 
 
 
424 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  27.63 
 
 
451 aa  91.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  27.33 
 
 
441 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  27.79 
 
 
426 aa  90.9  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  23.82 
 
 
426 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  27.33 
 
 
441 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  27.08 
 
 
441 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  26.04 
 
 
428 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  29.06 
 
 
370 aa  90.1  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  26.79 
 
 
441 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  26.79 
 
 
441 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  27.66 
 
 
440 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  27.4 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  26.79 
 
 
441 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  26.79 
 
 
441 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  26.98 
 
 
416 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  26.24 
 
 
441 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  23.82 
 
 
427 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  27.12 
 
 
424 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  25.13 
 
 
431 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  27.23 
 
 
577 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  26.15 
 
 
422 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  24.49 
 
 
422 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  25.4 
 
 
440 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  26.09 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  25.99 
 
 
441 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  23.51 
 
 
447 aa  82.8  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  26.8 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  29.81 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  24.34 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  26.77 
 
 
431 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  26.01 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  26.51 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  26.51 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  26.51 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  26.51 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  26.51 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  26.51 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  24.88 
 
 
429 aa  79.7  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  26.51 
 
 
372 aa  79.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  25.48 
 
 
415 aa  79.7  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>