171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3052 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3052  putative signal transduction protein  100 
 
 
349 aa  709    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2952  putative signal transduction protein  32.45 
 
 
358 aa  93.2  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.281688  normal  0.0690285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  31.18 
 
 
324 aa  92.4  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0013  putative signal transduction protein  25.09 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000360962 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0005  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0011  putative signal transduction protein  25.98 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0123691 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  26.67 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  25.98 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000619076 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0011  putative signal transduction protein  25.98 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0007  putative signal transduction protein  25.98 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0005  putative signal transduction protein  26.12 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373694  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0007  putative signal transduction protein  24.4 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000736166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  25.49 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0007  putative signal transduction protein  23.37 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0608223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0015  putative signal transduction protein  24.83 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189797 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0032  putative signal transduction protein  36.13 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0011  putative signal transduction protein  23.28 
 
 
334 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000072807 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0005  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387927  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  27.31 
 
 
517 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2585  putative signal transduction protein  29.19 
 
 
332 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  25.12 
 
 
326 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1104  metal dependent phosphohydrolase  30.95 
 
 
371 aa  60.5  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  27.61 
 
 
293 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1185  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  23.94 
 
 
696 aa  59.7  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0298  hypothetical protein  30.94 
 
 
285 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  29.69 
 
 
274 aa  57  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  29.69 
 
 
274 aa  57  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0275  hypothetical protein  30.22 
 
 
285 aa  57  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0247  hypothetical protein  30.22 
 
 
285 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  29.2 
 
 
292 aa  56.6  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  32 
 
 
477 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
703 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  17.49 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  27.4 
 
 
281 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  26.24 
 
 
274 aa  54.3  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  35.87 
 
 
277 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 
283 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  23.04 
 
 
300 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  30.7 
 
 
276 aa  53.1  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  28.77 
 
 
297 aa  53.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 
298 aa  52.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  28.24 
 
 
399 aa  52.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  26.26 
 
 
505 aa  52.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  24.29 
 
 
297 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  24.26 
 
 
480 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  25.89 
 
 
290 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0287  hypothetical protein  18.38 
 
 
366 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  24.06 
 
 
790 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1495  hypothetical protein  32.1 
 
 
484 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  33.73 
 
 
485 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4298  putative signal transduction protein  33.33 
 
 
499 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.184086 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1904  putative signal transduction protein  28.57 
 
 
272 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2872  hypothetical protein  32.1 
 
 
484 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2117  putative signal transduction protein  33.33 
 
 
499 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0709  putative signal transduction protein  33.33 
 
 
507 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1164  putative signal transduction protein  33.33 
 
 
502 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.115265 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1188  putative signal transduction protein  33.33 
 
 
507 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  28.8 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1356  hypothetical protein  32.1 
 
 
484 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1362  hypothetical protein  32.1 
 
 
484 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  22.75 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  26.57 
 
 
274 aa  51.2  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1068  putative signal transduction protein  33.33 
 
 
507 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1068  putative signal transduction protein  33.33 
 
 
507 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  22.66 
 
 
298 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  28.31 
 
 
456 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  21.23 
 
 
730 aa  50.4  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  30.83 
 
 
292 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  33.67 
 
 
791 aa  49.7  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  22.97 
 
 
274 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  27.19 
 
 
410 aa  49.7  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  26.94 
 
 
397 aa  49.7  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  29.79 
 
 
427 aa  49.7  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1043  putative signal transduction protein  30.43 
 
 
288 aa  49.7  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  26.17 
 
 
299 aa  49.7  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  26.28 
 
 
488 aa  49.3  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  27.03 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  23.26 
 
 
282 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0833  HDOD domain-contain protein  31.25 
 
 
202 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.149096  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00500  putative signal transduction protein  23.45 
 
 
406 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2515  putative signal transduction protein  29.27 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  23.94 
 
 
488 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  25.86 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  25.86 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  21.8 
 
 
297 aa  49.3  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  30.99 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  29.45 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  21.12 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  30 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  21.79 
 
 
283 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  29.3 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  23.31 
 
 
274 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  22.86 
 
 
299 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  23.94 
 
 
488 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  31.06 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2726  putative signal transduction protein  29.87 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  26.97 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  28.23 
 
 
280 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  31.4 
 
 
274 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  22.4 
 
 
351 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>