98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0032 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0032  putative signal transduction protein  100 
 
 
345 aa  697    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2585  putative signal transduction protein  42.34 
 
 
332 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  33 
 
 
324 aa  86.3  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2952  putative signal transduction protein  30.74 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.281688  normal  0.0690285 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3052  putative signal transduction protein  36.13 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  36.8 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0005  metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  29.41 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  33.33 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  31.34 
 
 
275 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  32.46 
 
 
275 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0011  putative signal transduction protein  31.25 
 
 
346 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  28.68 
 
 
384 aa  59.7  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0011  putative signal transduction protein  37.23 
 
 
346 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0123691 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0007  putative signal transduction protein  37.23 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  29.41 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  37.23 
 
 
346 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000619076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0005  putative signal transduction protein  36.17 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373694  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  26.71 
 
 
274 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  34.21 
 
 
292 aa  57.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  35.11 
 
 
266 aa  57.4  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0287  hypothetical protein  28.97 
 
 
366 aa  57  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  32.98 
 
 
274 aa  56.6  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  34.23 
 
 
298 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0013  putative signal transduction protein  24.58 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000360962 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  40.79 
 
 
399 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0011  putative signal transduction protein  29.81 
 
 
334 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000072807 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0007  putative signal transduction protein  35.11 
 
 
347 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000736166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0007  putative signal transduction protein  35.11 
 
 
347 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0608223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0015  putative signal transduction protein  35.11 
 
 
347 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189797 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  31.52 
 
 
274 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 
284 aa  52.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  31.52 
 
 
274 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  31.52 
 
 
274 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  31.52 
 
 
274 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  29.03 
 
 
730 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  25.49 
 
 
274 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0005  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
350 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387927  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  25.49 
 
 
274 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  25.49 
 
 
274 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  25.95 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1104  metal dependent phosphohydrolase  33.73 
 
 
371 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
300 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 
284 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  36.14 
 
 
297 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 
298 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.29 
 
 
412 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 
283 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 
283 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  32.24 
 
 
718 aa  50.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  23.86 
 
 
297 aa  50.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1912  hypothetical protein  23.42 
 
 
293 aa  49.7  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213081  normal  0.293367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  25.62 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  27.7 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  32.56 
 
 
278 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  29.76 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  40.3 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1904  putative signal transduction protein  30 
 
 
272 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  35.23 
 
 
283 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  32.91 
 
 
274 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  31.31 
 
 
297 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  37.5 
 
 
428 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1928  putative signal transduction protein  23.53 
 
 
260 aa  47.4  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  31.33 
 
 
284 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0557  Metal-dependent hydrolase HDOD  34.67 
 
 
269 aa  47  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.681688  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
284 aa  46.6  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 
284 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  30.12 
 
 
284 aa  46.2  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  29.27 
 
 
280 aa  46.6  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  32.1 
 
 
278 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  28.32 
 
 
282 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
299 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  26.83 
 
 
299 aa  46.2  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  31.08 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  28.85 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  29.41 
 
 
274 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  31.65 
 
 
292 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  32.1 
 
 
278 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  31.33 
 
 
280 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  34.85 
 
 
397 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  25.69 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  29.91 
 
 
275 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  30.36 
 
 
274 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0247  hypothetical protein  29.35 
 
 
285 aa  44.3  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0319  two component diguanylate cyclase  30.43 
 
 
661 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  28.24 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3190  diguanylate cyclase  31.82 
 
 
852 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  31.96 
 
 
406 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  30.36 
 
 
274 aa  44.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0275  hypothetical protein  29.35 
 
 
285 aa  44.3  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2726  putative signal transduction protein  31.96 
 
 
365 aa  43.5  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  23.44 
 
 
290 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0298  hypothetical protein  29.35 
 
 
285 aa  43.1  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  25.88 
 
 
281 aa  42.7  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  31.65 
 
 
282 aa  42.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  29.03 
 
 
280 aa  42.7  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  23.44 
 
 
290 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>