More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1339 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
384 aa  778  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.83 
 
 
438 aa  364  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  50.56 
 
 
414 aa  328  1e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3721  putative membrane-fusion protein  62.77 
 
 
569 aa  322  7e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45383  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.63 
 
 
392 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  45.66 
 
 
387 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  43.54 
 
 
390 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  45.17 
 
 
407 aa  283  3e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  44.95 
 
 
391 aa  283  4e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  42.82 
 
 
408 aa  282  5e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  42.55 
 
 
408 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  44.68 
 
 
391 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  42.59 
 
 
415 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  43.55 
 
 
409 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3282  RND family efflux transporter MFP subunit  43.53 
 
 
410 aa  272  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.68571  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  41.4 
 
 
390 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.09 
 
 
410 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  41.08 
 
 
391 aa  259  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  41.43 
 
 
397 aa  259  5e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3415  secretion protein HlyD  41.43 
 
 
397 aa  259  5e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  41.43 
 
 
397 aa  259  5e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  41.1 
 
 
397 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.43 
 
 
390 aa  255  1e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  42.66 
 
 
385 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1791  macrolide efflux protein MacA  40.69 
 
 
420 aa  252  8e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  39.53 
 
 
428 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0927  macrolide efflux protein MacA  39.63 
 
 
399 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  39.53 
 
 
435 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5132  RND family efflux transporter MFP subunit  45.15 
 
 
445 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.44 
 
 
401 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  41.34 
 
 
383 aa  244  2e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2214  secretion protein HlyD  42.86 
 
 
382 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155205  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  38.19 
 
 
405 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2452  RND family efflux transporter MFP subunit  38.81 
 
 
428 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2042  secretion protein HlyD  41.03 
 
 
414 aa  238  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.617858  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  36.27 
 
 
430 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2236  secretion protein HlyD  36.94 
 
 
404 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.18 
 
 
397 aa  226  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1295  efflux protein  37.11 
 
 
405 aa  226  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2317  RND family efflux transporter MFP subunit  38.85 
 
 
393 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.788366  normal  0.425659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  39.35 
 
 
409 aa  222  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  2.85815e-06  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  38.62 
 
 
370 aa  222  1e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  38.62 
 
 
370 aa  222  1e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  37.57 
 
 
371 aa  222  1e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  37.57 
 
 
371 aa  222  1e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  37.57 
 
 
371 aa  222  1e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  37.57 
 
 
371 aa  222  1e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  37.57 
 
 
371 aa  222  1e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  37.57 
 
 
371 aa  222  1e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  38.36 
 
 
370 aa  221  2e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  37.57 
 
 
371 aa  221  2e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  38.1 
 
 
399 aa  221  2e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  35.23 
 
 
393 aa  220  4e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.29 
 
 
371 aa  219  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  37.29 
 
 
371 aa  219  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  3.39116e-09  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.54 
 
 
399 aa  217  3e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.97 
 
 
410 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.9827e-08  hitchhiker  2.36896e-09 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  38.25 
 
 
405 aa  216  6e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0096  putative macrolide-specific efflux protein MacA  36.26 
 
 
399 aa  216  8e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  38.67 
 
 
416 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  6.42362e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  33.6 
 
 
394 aa  215  9e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  38.4 
 
 
416 aa  214  1e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.21535e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  38.67 
 
 
416 aa  215  1e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.87508e-07  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  41.64 
 
 
348 aa  215  1e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  34.43 
 
 
406 aa  214  2e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6610  RND family efflux transporter MFP subunit  37.01 
 
 
394 aa  214  3e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260284  normal  0.566522 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  34.43 
 
 
406 aa  214  3e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2466  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.81 
 
 
396 aa  213  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  38.84 
 
 
371 aa  212  8e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1312  RND efflux transporter  34.71 
 
 
401 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.30358e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1423  RND family efflux transporter MFP subunit  34.44 
 
 
401 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2754  RND efflux transporter  34.44 
 
 
401 aa  210  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.26253e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.6 
 
 
398 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  37.47 
 
 
372 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 
396 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  37.2 
 
 
372 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  37.2 
 
 
372 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  37.2 
 
 
372 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2603  secretion protein HlyD  38.38 
 
 
389 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22725  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  36.39 
 
 
372 aa  201  2e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2938  RND family efflux transporter MFP subunit  37.74 
 
 
444 aa  201  2e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3197  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.36 
 
 
387 aa  198  1e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.822347  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3445  RND family efflux transporter MFP subunit  37.33 
 
 
401 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655677  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  34.82 
 
 
416 aa  196  4e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.24755e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  32.5 
 
 
464 aa  196  6e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  9.06287e-10 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  32.46 
 
 
397 aa  196  7e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  36.8 
 
 
394 aa  195  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  33.04 
 
 
402 aa  195  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  34.7 
 
 
456 aa  192  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  34.56 
 
 
455 aa  191  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  1.23833e-12  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  32.28 
 
 
390 aa  190  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2116  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.6 
 
 
393 aa  189  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419105  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  32.56 
 
 
390 aa  186  9e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  32.27 
 
 
390 aa  182  9e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  29.57 
 
 
377 aa  177  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.3 
 
 
419 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  34.19 
 
 
413 aa  157  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  33.88 
 
 
489 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  9.75793e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  32.55 
 
 
402 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.89 
 
 
430 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>