More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0542 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl537  ribonuclease HII, primer excision  54.5 
 
 		 208 aa  202  2e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000093074  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 206 aa  171  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  45.41 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 202 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 202 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  44.92 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  44.92 
 
 		 257 aa  165  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  47.51 
 
 		 268 aa  165  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  45.11 
 
 		 212 aa  164  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  41.03 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  43.52 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  43.52 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  42.13 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  42.7 
 
 		 211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  43.52 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  40.51 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  49.15 
 
 		 256 aa  161  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  40.28 
 
 		 240 aa  161  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  43.52 
 
 		 207 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1643  ribonuclease HII  45.03 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  42.16 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  42.25 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  40.67 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1459  ribonuclease HII  43.96 
 
 		 210 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0235521  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2888  ribonuclease HII  43.48 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0614829  normal  0.459177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  42.11 
 
 		 235 aa  158  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2694  ribonuclease HII  44.92 
 
 		 209 aa  157  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.529016  hitchhiker  0.00296162 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  40.51 
 
 		 219 aa  157  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  42.41 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1495  ribonuclease HII  43.48 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0185949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  39.38 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  40.67 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1362  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  40.74 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  42.63 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  42.93 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  44.15 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  39.46 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  43.56 
 
 		 242 aa  155  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2627  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0862434 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  41.3 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1464  ribonuclease HII  43.84 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0142588  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 209 aa  154  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 209 aa  154  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  41.84 
 
 		 249 aa  154  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  43.92 
 
 		 204 aa  154  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  41.8 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  39.34 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  40.98 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  41.53 
 
 		 203 aa  152  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  40.98 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  40.98 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  42.16 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  42.05 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1375  ribonuclease HII  43.39 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000308633  normal  0.450716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2801  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.907957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  39.59 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  40.5 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  38.66 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  40.22 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  41.76 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  40.66 
 
 		 198 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  40.66 
 
 		 198 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  46.45 
 
 		 199 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  40.66 
 
 		 198 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  41.24 
 
 		 202 aa  151  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  42.02 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  41.62 
 
 		 248 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  40.76 
 
 		 198 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  40.76 
 
 		 198 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  43.16 
 
 		 259 aa  151  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  42.62 
 
 		 221 aa  151  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  41.45 
 
 		 232 aa  151  8.999999999999999e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  37.95 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  39.66 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  38.59 
 
 		 307 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  39.15 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  44.92 
 
 		 257 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  43.41 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  37.76 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  41.4 
 
 		 250 aa  149  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  40.1 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  40.44 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  38.78 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  40.54 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  44.92 
 
 		 257 aa  148  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  43.17 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  43.96 
 
 		 216 aa  148  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>