More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1894 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  493  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  38.84 
 
 
242 aa  193  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  42.68 
 
 
238 aa  185  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  40.32 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  35.18 
 
 
270 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  33.48 
 
 
222 aa  155  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  36.97 
 
 
258 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  34.11 
 
 
221 aa  142  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  35.19 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  34.48 
 
 
242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  29.49 
 
 
238 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  32.05 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  29.82 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  41.54 
 
 
141 aa  128  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  29.03 
 
 
222 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  35.56 
 
 
242 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  35 
 
 
238 aa  122  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  28.9 
 
 
222 aa  122  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  29.55 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  33.61 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  32.09 
 
 
237 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  30.32 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  27.43 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  29.2 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  28.99 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  32.31 
 
 
245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  31.22 
 
 
246 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  31.22 
 
 
246 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  27.23 
 
 
224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  27.9 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  31.48 
 
 
244 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  28.74 
 
 
261 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  27.9 
 
 
235 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  27.9 
 
 
235 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  27.9 
 
 
235 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  31.22 
 
 
243 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  27.47 
 
 
235 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  25.65 
 
 
237 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  29.36 
 
 
224 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  31.76 
 
 
243 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  27.47 
 
 
235 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  27.27 
 
 
223 aa  105  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  27.16 
 
 
235 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  27.47 
 
 
235 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  33.66 
 
 
238 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  27.04 
 
 
235 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  27.07 
 
 
243 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  34.74 
 
 
247 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  32.47 
 
 
235 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  26.54 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  32.52 
 
 
245 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  31.86 
 
 
234 aa  99.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  27.07 
 
 
227 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  27.07 
 
 
227 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  27.27 
 
 
224 aa  99  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  28.31 
 
 
226 aa  97.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  29.02 
 
 
235 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  31.98 
 
 
237 aa  95.5  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  30.67 
 
 
240 aa  95.5  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  30.13 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  27.88 
 
 
235 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  28.16 
 
 
232 aa  92.4  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  27.11 
 
 
239 aa  92.4  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  27.43 
 
 
235 aa  92  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  24.26 
 
 
252 aa  91.7  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  30.45 
 
 
234 aa  90.9  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  31.1 
 
 
236 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  29.44 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  28.95 
 
 
244 aa  89.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  31.53 
 
 
244 aa  89.4  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  31.53 
 
 
244 aa  89.4  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  28.88 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  28.71 
 
 
254 aa  89  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  30.77 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  29.49 
 
 
242 aa  85.9  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  30.25 
 
 
308 aa  85.5  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  25.88 
 
 
251 aa  85.1  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  26.36 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  21.05 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  24.34 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  31.93 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  29.31 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  25.21 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  32.32 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  26.37 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  26.58 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  30.9 
 
 
320 aa  82.4  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  82  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  32.23 
 
 
217 aa  82  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  40.21 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  29.91 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  25.24 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  24.4 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  23.83 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  29.37 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  28.45 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  28.07 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2219  protein of unknown function DUF45  44.44 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2282  protein of unknown function DUF45  44.44 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.879838  hitchhiker  0.00256901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>