More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0152 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
403 aa  791    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
404 aa  106  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 
402 aa  97.4  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
392 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
402 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
385 aa  88.2  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1098  glycosyl transferase, group 1  34.13 
 
 
399 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000174452 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6558  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
458 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  23.88 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
463 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  28.27 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 
386 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  28.21 
 
 
723 aa  76.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.44 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
446 aa  73.2  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
416 aa  73.2  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
445 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
409 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1361  Glycosyltransferase-like protein  35.06 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 
481 aa  72.4  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  28.94 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  35.09 
 
 
569 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  29.26 
 
 
415 aa  70.5  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
457 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  39.58 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
428 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26790  glycosyltransferase  30.85 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  30.24 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
394 aa  69.7  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  24.87 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
410 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.19 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.98 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  31.61 
 
 
557 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  26.53 
 
 
654 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  21.49 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
416 aa  67  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
390 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1684  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 
409 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  26.89 
 
 
564 aa  66.2  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
516 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.13 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
535 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
387 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12393  Glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 
336 aa  65.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  25.71 
 
 
382 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  22.39 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 
426 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
381 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 
370 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.46 
 
 
382 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
415 aa  64.3  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
402 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
402 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1692  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
375 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  30.52 
 
 
407 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
414 aa  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
394 aa  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3853  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
384 aa  63.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.208611  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
414 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
476 aa  63.5  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
422 aa  63.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.58 
 
 
393 aa  63.2  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 
467 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>