More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4754 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  89.11 
 
 		 468 aa  806    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  73.09 
 
 		 459 aa  696    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  73.83 
 
 		 457 aa  684    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  80.22 
 
 		 464 aa  741    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  81.51 
 
 		 461 aa  744    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  73.67 
 
 		 457 aa  693    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  74.05 
 
 		 457 aa  684    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  78.21 
 
 		 469 aa  738    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  71.37 
 
 		 477 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  74.05 
 
 		 457 aa  689    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  81.47 
 
 		 461 aa  753    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  73.18 
 
 		 468 aa  699    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  100 
 
 		 467 aa  927    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  80.53 
 
 		 461 aa  733    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  69.8 
 
 		 477 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  81.51 
 
 		 461 aa  744    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  70.58 
 
 		 477 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  67.19 
 
 		 463 aa  607  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2371  major facilitator transporter  69.21 
 
 		 406 aa  585  1e-166  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.363547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0102  major facilitator superfamily MFS_1  54.33 
 
 		 456 aa  438  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  49.53 
 
 		 493 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  48.59 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  46.9 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 458 aa  343  5e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 442 aa  341  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  41.54 
 
 		 452 aa  336  5e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 468 aa  333  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 		 439 aa  332  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  44.19 
 
 		 439 aa  326  5e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  39.12 
 
 		 450 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  37.11 
 
 		 446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  36.41 
 
 		 447 aa  270  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  37.35 
 
 		 482 aa  259  7e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 		 442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  35.17 
 
 		 468 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  33.56 
 
 		 430 aa  253  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.41 
 
 		 447 aa  250  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  35.54 
 
 		 443 aa  250  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 461 aa  247  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  35.06 
 
 		 461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 440 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  35.06 
 
 		 461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  35.06 
 
 		 461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 450 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  36.76 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  34.26 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.56 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  36.24 
 
 		 463 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  36.24 
 
 		 463 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  36.24 
 
 		 463 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  35.75 
 
 		 447 aa  239  9e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 445 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  35.66 
 
 		 441 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  35.71 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  33.85 
 
 		 484 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 		 436 aa  237  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  32.87 
 
 		 435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  32.87 
 
 		 435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  34.62 
 
 		 456 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  32.95 
 
 		 434 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  35.65 
 
 		 460 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  35.45 
 
 		 433 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  34.66 
 
 		 460 aa  236  7e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  35.45 
 
 		 433 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  35.45 
 
 		 433 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  32.95 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  34.37 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 438 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  33.59 
 
 		 435 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1934  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.11 
 
 		 459 aa  234  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  34.79 
 
 		 452 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  35.73 
 
 		 455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 445 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  33.66 
 
 		 430 aa  233  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.53 
 
 		 437 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 445 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 445 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.86 
 
 		 438 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 444 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  33.59 
 
 		 435 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  33.59 
 
 		 435 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1044  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 443 aa  232  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 441 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  32.11 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.43 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 437 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 460 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  34.19 
 
 		 430 aa  231  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  34.39 
 
 		 433 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>