More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0871 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  100 
 
 
416 aa  799    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  51.06 
 
 
422 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  53.59 
 
 
433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  44.05 
 
 
393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  54.71 
 
 
427 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  53.32 
 
 
431 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  46.01 
 
 
389 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  46.01 
 
 
389 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2797  major facilitator transporter  53.77 
 
 
427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0309  major facilitator transporter  53.77 
 
 
427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000378785  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  53.54 
 
 
427 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000369004  unclonable  0.0000000000514998 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  42.41 
 
 
404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  42.13 
 
 
405 aa  269  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  43.16 
 
 
396 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  49.63 
 
 
419 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  48.99 
 
 
419 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  42.53 
 
 
405 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  42.53 
 
 
405 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  42.53 
 
 
405 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  41.92 
 
 
395 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  42.32 
 
 
407 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  41.98 
 
 
398 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  41.15 
 
 
405 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  42.05 
 
 
404 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  42.34 
 
 
405 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  43.67 
 
 
398 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3860  major facilitator transporter  49.63 
 
 
442 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320217  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0028  MFS permease  48.54 
 
 
422 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000623855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3799  major facilitator transporter  48.54 
 
 
433 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000291886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  44.28 
 
 
413 aa  256  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0236  major facilitator transporter  54.05 
 
 
423 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00013187  hitchhiker  0.000000000803869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  42.96 
 
 
401 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0228  major facilitator transporter  54.29 
 
 
425 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000132249  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  43.5 
 
 
402 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  42.32 
 
 
398 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 
388 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 
447 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  41.16 
 
 
400 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  41.16 
 
 
400 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  41.16 
 
 
400 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  38.02 
 
 
399 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  38.02 
 
 
399 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  44.72 
 
 
402 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  42.93 
 
 
406 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  38.17 
 
 
385 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  39.24 
 
 
399 aa  236  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  45.73 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  36.34 
 
 
394 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  37.97 
 
 
399 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  40.93 
 
 
400 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  42.9 
 
 
405 aa  216  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 
397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  37.5 
 
 
395 aa  213  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  42.75 
 
 
401 aa  212  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  38.99 
 
 
404 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  35.56 
 
 
399 aa  209  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  35.56 
 
 
399 aa  209  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  35.31 
 
 
399 aa  208  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  41.44 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  37.23 
 
 
399 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  42.28 
 
 
399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  42.33 
 
 
402 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  41.87 
 
 
399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  37.44 
 
 
383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  35.46 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  37.4 
 
 
415 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  38.01 
 
 
399 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  30.79 
 
 
406 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  30.79 
 
 
406 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  41.94 
 
 
399 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  41.43 
 
 
399 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  39.53 
 
 
389 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  30.79 
 
 
403 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  36.48 
 
 
400 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  37.96 
 
 
399 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  38.7 
 
 
391 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  29.63 
 
 
392 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  38.87 
 
 
389 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  35.99 
 
 
390 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  44.9 
 
 
409 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  37.19 
 
 
429 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  37.19 
 
 
429 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  37.19 
 
 
398 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  37.19 
 
 
398 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  37.19 
 
 
398 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  43.36 
 
 
413 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  37.19 
 
 
398 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  37.19 
 
 
398 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  33.93 
 
 
403 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 
406 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  38.65 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  38.66 
 
 
399 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  38.52 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 
406 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  37.78 
 
 
399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  37.53 
 
 
399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  37.53 
 
 
399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  37.63 
 
 
399 aa  183  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  37.63 
 
 
399 aa  183  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>