More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0350 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0171  drug resistance transporter,putative, EmrB/QacA subfamily  99.81 
 
 		 534 aa  1024    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.966244  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0350  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 520 aa  1025    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.976424  normal  0.915508 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2030  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.57 
 
 		 515 aa  388  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.25 
 
 		 537 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  29.09 
 
 		 511 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 		 511 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  29.09 
 
 		 511 aa  209  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0040  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.94 
 
 		 540 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.295395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0041  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 551 aa  207  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.89 
 
 		 511 aa  205  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.92 
 
 		 527 aa  205  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.36 
 
 		 521 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.36 
 
 		 520 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.67 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.86 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.55 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.25 
 
 		 522 aa  201  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.88 
 
 		 524 aa  200  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.57 
 
 		 519 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.7 
 
 		 519 aa  199  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.25 
 
 		 522 aa  199  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135195 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.57 
 
 		 519 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.57 
 
 		 519 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.61 
 
 		 520 aa  198  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  28.78 
 
 		 518 aa  196  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.12 
 
 		 521 aa  195  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.477871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  28.83 
 
 		 512 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1635  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.95 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296627  decreased coverage  0.000294236 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.67 
 
 		 522 aa  194  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  28.83 
 
 		 512 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  28.6 
 
 		 512 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  28.6 
 
 		 512 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.28 
 
 		 515 aa  193  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.75 
 
 		 519 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3598  multidrug resistance protein Y  27.71 
 
 		 512 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0257273 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.16 
 
 		 518 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.67 
 
 		 525 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.16 
 
 		 518 aa  192  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.05 
 
 		 520 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.13 
 
 		 519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.16 
 
 		 519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29 
 
 		 531 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.08 
 
 		 544 aa  190  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0889  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.02 
 
 		 513 aa  190  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02277  predicted multidrug efflux system  27.5 
 
 		 512 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.866508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 519 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 519 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.63 
 
 		 577 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02238  hypothetical protein  27.5 
 
 		 512 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.945599  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7509  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.83 
 
 		 517 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.91 
 
 		 519 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.72 
 
 		 517 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.5 
 
 		 512 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2504  multidrug resistance protein Y  27.5 
 
 		 512 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0957152  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  28.6 
 
 		 512 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0252817 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2736  multidrug resistance protein Y  27.5 
 
 		 512 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.416223  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.85 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2653  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.5 
 
 		 512 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1302  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.5 
 
 		 512 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2517  multidrug resistance protein Y  27.5 
 
 		 512 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0322  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.67 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516199 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.28 
 
 		 533 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2022  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.8 
 
 		 520 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.25 
 
 		 543 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  29.06 
 
 		 512 aa  187  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4472  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.18 
 
 		 519 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238318  normal  0.949404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  28.83 
 
 		 512 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.83 
 
 		 512 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.83 
 
 		 512 aa  186  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  28.83 
 
 		 512 aa  186  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.35 
 
 		 520 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  28.83 
 
 		 512 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  28.83 
 
 		 512 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  28.83 
 
 		 512 aa  186  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  28.51 
 
 		 519 aa  186  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.96 
 
 		 520 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.96 
 
 		 520 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.96 
 
 		 520 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.91 
 
 		 520 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4010  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.95 
 
 		 519 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.71 
 
 		 520 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.3 
 
 		 518 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.87 
 
 		 517 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.36 
 
 		 520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.64 
 
 		 520 aa  183  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5722  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.72 
 
 		 519 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102537  normal  0.245407 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.72 
 
 		 519 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196393  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4583  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.72 
 
 		 519 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0858  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 515 aa  182  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916368  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5791  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.44 
 
 		 517 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0859755  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3190  multidrug resistance protein B  28.34 
 
 		 515 aa  180  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313882  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.96 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.9 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.9 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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