More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0322 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0322  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 158 aa  326  8e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000362186  hitchhiker  1.16201e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  64.63 
 
 		 147 aa  209  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  65.99 
 
 		 147 aa  207  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  66.44 
 
 		 148 aa  202  2e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  65.31 
 
 		 148 aa  199  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  65.07 
 
 		 148 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000083935  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0628  50S ribosomal protein L13  63.51 
 
 		 148 aa  197  3e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0115715  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 145 aa  177  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 145 aa  177  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  61.15 
 
 		 149 aa  174  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 145 aa  174  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 145 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 145 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 145 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 145 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 145 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 145 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 145 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  55.4 
 
 		 147 aa  167  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  55.4 
 
 		 149 aa  167  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 147 aa  167  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  56.12 
 
 		 147 aa  167  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 145 aa  166  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 148 aa  166  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  55 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  55 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0434  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0288817  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  51.09 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  53.03 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 145 aa  164  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  53.24 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  53.96 
 
 		 147 aa  164  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  55.07 
 
 		 145 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 143 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  58.27 
 
 		 150 aa  163  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  53.28 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 143 aa  163  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  163  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 144 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  52.55 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  54.68 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  54.07 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  53.79 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  53.79 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  53.28 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  54.01 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  51.08 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  51.08 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  51.82 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  53.96 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  51.82 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  51.82 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3518  50S ribosomal protein L13  52.27 
 
 		 149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3372  50S ribosomal protein L13  52.27 
 
 		 149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.165547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3454  50S ribosomal protein L13  52.27 
 
 		 149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  51.82 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  51.82 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  54.01 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  54.07 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  54.68 
 
 		 147 aa  160  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  54.01 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 143 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  160  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  51.52 
 
 		 146 aa  160  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>