218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0028 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0028  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  573  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19210  hypothetical protein  37.28 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0436232 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3344  DegV family protein  32.73 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000036416  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1216  DegV family protein  29.5 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11340  DegV family protein  32.62 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  32.59 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  27.21 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  33.33 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0910  hypothetical protein  28.42 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104198 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  28.42 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  30.6 
 
 		 287 aa  95.9  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  26.56 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  25 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  28.83 
 
 		 284 aa  92.8  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  30.41 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  30.41 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  28.57 
 
 		 291 aa  92  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  26.5 
 
 		 279 aa  92  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  30.59 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  29.08 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  28.67 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  27.93 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0521  hypothetical protein  27.18 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  28.47 
 
 		 281 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  30.88 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  27.82 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1061  degV family protein  25.68 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0946944  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  26.6 
 
 		 285 aa  89  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  31.67 
 
 		 291 aa  89  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  28.72 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0772  degV family protein  26.06 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  29.27 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  28.86 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1178  DegV family protein  30.09 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000234319  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  29.22 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  26.51 
 
 		 292 aa  86.3  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  31.48 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  31.02 
 
 		 281 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  25.26 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  29.15 
 
 		 280 aa  85.5  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  27.91 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  27.91 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  27.91 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  28.64 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  26.69 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  28.64 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  29.61 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  26.71 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  30.17 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  26.82 
 
 		 637 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  28.47 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  32.44 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0758  hypothetical protein  31.13 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.642534  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  27.11 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  28.89 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  28.11 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  28.11 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  25.26 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  24.91 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  25 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  27.17 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  25.9 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  25 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  27.23 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  27.74 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  30.49 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  25 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  23.94 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  27.68 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  27.68 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0502  DegV family protein  30.04 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  24.65 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1032  degV family protein  24.29 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.185654  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  26.3 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  25.9 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  28.51 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  30.7 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  24.57 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  26.01 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  24.65 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16150  hypothetical protein  30 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239728 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  24.65 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  24.65 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  24.65 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  25.52 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  24.38 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  29.09 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0362  degV family protein  29.52 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  28.12 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  24.3 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  24.65 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  28.04 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  24.2 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  30.26 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  26.67 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  26.99 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  24.65 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  28.39 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  32.41 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  29.66 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>