More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0019 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  100 
 
 		 208 aa  422  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  37.32 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  34.76 
 
 		 210 aa  121  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.62 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  32.52 
 
 		 217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  30.11 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  30.84 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.65 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  29.95 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.51 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  30.19 
 
 		 215 aa  97.8  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  28.49 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.42 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  31.69 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  30.05 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  30.98 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  31.15 
 
 		 216 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.35 
 
 		 217 aa  95.1  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.14 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.07 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1652  HAD family hydrolase  32.71 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  30.43 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  30.43 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  30.43 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  30.43 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  30.43 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.57 
 
 		 296 aa  92.4  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  28.91 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  30.43 
 
 		 216 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  28.29 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  28.77 
 
 		 222 aa  89  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  29.32 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.32 
 
 		 233 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.32 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  26.94 
 
 		 209 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  29.65 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  31.91 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  26.2 
 
 		 219 aa  84.7  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  28.49 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0100  HAD family hydrolase  30.27 
 
 		 468 aa  82  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0368988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  26.2 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.77 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  25.54 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.23 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  26.07 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  26.89 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.68 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  30.46 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.7 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  27.08 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  24.55 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.04 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  32.23 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.35 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  27.94 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  33.01 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0740  hypothetical protein  28.65 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.6 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  27.54 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.67 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  24.65 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.76 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.41 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.1 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  22.86 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.36 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  28.32 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  25.57 
 
 		 252 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  25.57 
 
 		 252 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  27.93 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  25.57 
 
 		 252 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  25.57 
 
 		 252 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1246  HAD superfamily hydrolase  28.11 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  25.57 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  25.93 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  29.02 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  25.68 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  29.29 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.85 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  25.68 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  25.11 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  25.68 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.49 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  27.59 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  24.2 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  24.2 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  26.18 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  24.66 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.58 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  25.51 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  26.04 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  25.91 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.27 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  24.2 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  25.35 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>