More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1936 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1936  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 		 245 aa  501  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0352158  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1511  ABC transporter related  75.31 
 
 		 246 aa  385  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1634  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  75.52 
 
 		 251 aa  381  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0528  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  66.39 
 
 		 258 aa  334  7.999999999999999e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191469  normal  0.015863 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  61.67 
 
 		 242 aa  309  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  59.58 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  60.83 
 
 		 242 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  59.58 
 
 		 247 aa  300  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0718  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.07 
 
 		 251 aa  298  6e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000110627  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  61.25 
 
 		 248 aa  297  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  61.25 
 
 		 248 aa  297  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  57.26 
 
 		 246 aa  296  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1117  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60.66 
 
 		 255 aa  295  4e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000186599  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  58.26 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.79 
 
 		 252 aa  290  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.79 
 
 		 252 aa  290  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  57.08 
 
 		 242 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.56 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  56.79 
 
 		 252 aa  288  6e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  58.26 
 
 		 249 aa  288  6e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.38 
 
 		 252 aa  288  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.38 
 
 		 252 aa  288  7e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  57.5 
 
 		 239 aa  287  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  55.37 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  55.79 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  58.33 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  54.55 
 
 		 242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  55.97 
 
 		 252 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  55.97 
 
 		 252 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 240 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  55.97 
 
 		 252 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.97 
 
 		 252 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  55.97 
 
 		 252 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  55.83 
 
 		 244 aa  285  5.999999999999999e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  55.33 
 
 		 244 aa  284  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  52.89 
 
 		 242 aa  284  9e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  54.58 
 
 		 249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  56.67 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  56.2 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  56.2 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  55.74 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  54.96 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  56.2 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  58.16 
 
 		 246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  58.26 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  55.83 
 
 		 255 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 		 257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  55.79 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  56.02 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  56.15 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  56.02 
 
 		 243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  56.02 
 
 		 258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  54.13 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  55.37 
 
 		 253 aa  281  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  58.33 
 
 		 246 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  55.74 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  56.43 
 
 		 243 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4182  ABC transporter related protein  55.65 
 
 		 261 aa  281  8.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3991  ABC transporter related  55.42 
 
 		 261 aa  281  9e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  56.02 
 
 		 251 aa  280  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  55.6 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  56.02 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  57.68 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  55.79 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  55.56 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  55.42 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.85 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  57.5 
 
 		 257 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0552  ABC transporter related  60 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.37 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  55.42 
 
 		 256 aa  279  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  55.37 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0892  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  56.67 
 
 		 242 aa  278  4e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.495443  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  55 
 
 		 247 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  55.37 
 
 		 249 aa  279  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0929  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  56.67 
 
 		 242 aa  278  4e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.285427  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  55.83 
 
 		 247 aa  278  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  57.08 
 
 		 246 aa  279  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  55.65 
 
 		 247 aa  278  4e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1165  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  57.08 
 
 		 242 aa  278  4e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.19439  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.23 
 
 		 246 aa  278  6e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  52.89 
 
 		 243 aa  278  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4070  ABC transporter-related protein  55.56 
 
 		 245 aa  278  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1000  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  56.67 
 
 		 242 aa  278  7e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 		 245 aa  278  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5607  ABC transporter related  55.79 
 
 		 244 aa  278  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  55.37 
 
 		 241 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  55.37 
 
 		 241 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6962  ABC transporter related  54.96 
 
 		 241 aa  278  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  55.23 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0675  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2685  ABC transporter-related protein  54.55 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.480561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4021  ABC transporter-related protein  54.55 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248641 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  54.22 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  54.55 
 
 		 264 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  55.83 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3166  ABC transporter related  55.19 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.631435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  54.39 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4663  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 242 aa  276  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.583474  hitchhiker  2.7569099999999997e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>