160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00730 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  100 
 
 
529 aa  1072  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  70.3 
 
 
507 aa  704  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  62.63 
 
 
463 aa  593  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  64.37 
 
 
474 aa  594  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  60.32 
 
 
483 aa  585  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  60.69 
 
 
482 aa  580  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  59.56 
 
 
483 aa  577  1e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.39 
 
 
485 aa  572  1e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  60.9 
 
 
503 aa  570  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  59.24 
 
 
495 aa  545  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  57.11 
 
 
570 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  63.18 
 
 
500 aa  535  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  61.32 
 
 
492 aa  531  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  44.33 
 
 
454 aa  362  8e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  50.38 
 
 
447 aa  349  9e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  49.88 
 
 
437 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  39.96 
 
 
527 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  40.59 
 
 
539 aa  285  1e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  42.03 
 
 
433 aa  281  3e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  43.86 
 
 
539 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  40.29 
 
 
538 aa  277  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  39.64 
 
 
509 aa  277  4e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  40.19 
 
 
535 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  36.8 
 
 
650 aa  243  8e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 
341 aa  55.5  2e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 
238 aa  54.7  4e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
240 aa  53.9  8e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
292 aa  52.8  1e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
289 aa  52.4  2e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137743 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.18 
 
 
277 aa  51.6  4e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 
254 aa  51.2  5e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.24 
 
 
256 aa  50.8  6e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.6 
 
 
251 aa  50.8  6e-05  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
227 aa  50.8  6e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 
292 aa  50.8  6e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
264 aa  50.8  7e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
247 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  43.48 
 
 
319 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 
261 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 
294 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
326 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
286 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
239 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 
328 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 
292 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 
340 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
343 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
268 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152096  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
256 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
266 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 
301 aa  47.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
255 aa  47.8  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 
249 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
246 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 
291 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  31.91 
 
 
1955 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
351 aa  47.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
246 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
246 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
246 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
252 aa  47  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
339 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
257 aa  47  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
309 aa  47  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 
248 aa  47  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
241 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.612268  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2394  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
268 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.097477 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
257 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
253 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
265 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  28.95 
 
 
413 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 
258 aa  46.6  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.063344  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
255 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.87 
 
 
247 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 
291 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
324 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
266 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4238  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 
268 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 
308 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
284 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.06 
 
 
290 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
286 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 
245 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.35981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  32.61 
 
 
318 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 
291 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0281  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  32.63 
 
 
257 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2577  short chain dehydrogenase  41.05 
 
 
316 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
284 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 
263 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
257 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.560297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
241 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 
252 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
285 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 
251 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  39.13 
 
 
254 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  23.75 
 
 
417 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 
313 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
286 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
366 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.642345  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>