More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4061 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  100 
 
 		 490 aa  965    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  51.22 
 
 		 480 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  49.13 
 
 		 477 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  47.76 
 
 		 450 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  47.06 
 
 		 482 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  46.34 
 
 		 480 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  42.16 
 
 		 480 aa  373  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  46.04 
 
 		 468 aa  359  7e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  42.58 
 
 		 472 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  45.45 
 
 		 497 aa  346  7e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  45.6 
 
 		 475 aa  338  9e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  40.39 
 
 		 464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  36.95 
 
 		 473 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  38.27 
 
 		 473 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  37.26 
 
 		 492 aa  277  4e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  36.47 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  37.34 
 
 		 480 aa  268  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  36.87 
 
 		 477 aa  263  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0869  D-xylose proton-symporter  34.26 
 
 		 457 aa  259  6e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  35.25 
 
 		 468 aa  256  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  35.28 
 
 		 471 aa  255  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  34.77 
 
 		 476 aa  251  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1766  D-xylose proton-symporter  32.49 
 
 		 462 aa  247  3e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.946299  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  35.78 
 
 		 459 aa  247  4e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  35.19 
 
 		 463 aa  245  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  34.97 
 
 		 463 aa  242  9e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  33.55 
 
 		 466 aa  242  9e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  34.06 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  37.88 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  35.22 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  35.11 
 
 		 507 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  38.88 
 
 		 447 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  34.36 
 
 		 471 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  35.87 
 
 		 482 aa  236  8e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  34.36 
 
 		 471 aa  236  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  34.36 
 
 		 471 aa  236  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  35.33 
 
 		 452 aa  234  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  34.87 
 
 		 491 aa  234  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  35.73 
 
 		 467 aa  233  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  31.91 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  34.8 
 
 		 465 aa  230  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  33.93 
 
 		 464 aa  230  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  33.93 
 
 		 464 aa  230  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  33.93 
 
 		 464 aa  230  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  33.93 
 
 		 464 aa  230  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  33.93 
 
 		 464 aa  230  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  33.93 
 
 		 464 aa  230  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  33.93 
 
 		 464 aa  230  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  31.98 
 
 		 533 aa  229  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  35.02 
 
 		 464 aa  229  9e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  34.14 
 
 		 464 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  34.14 
 
 		 464 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  32.75 
 
 		 466 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  34.14 
 
 		 464 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  34.14 
 
 		 464 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  33.7 
 
 		 464 aa  229  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  34.14 
 
 		 464 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  32.24 
 
 		 480 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  32.48 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  32.48 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  32.48 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  32.48 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  34.43 
 
 		 458 aa  225  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  31.91 
 
 		 472 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  31.91 
 
 		 472 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  32.48 
 
 		 472 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  31.91 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  31.91 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  31.91 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  32.31 
 
 		 457 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  31.91 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  31.91 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  32.89 
 
 		 482 aa  222  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  33.77 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  32.44 
 
 		 472 aa  221  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  31.91 
 
 		 472 aa  221  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  31.69 
 
 		 472 aa  220  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  32.09 
 
 		 471 aa  220  6e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  36.05 
 
 		 480 aa  219  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  31.75 
 
 		 477 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  32.54 
 
 		 484 aa  216  7e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  32.38 
 
 		 448 aa  216  7e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  32.95 
 
 		 450 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  33.64 
 
 		 449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  34.65 
 
 		 516 aa  213  9e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  32.11 
 
 		 544 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  33.33 
 
 		 485 aa  210  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  31.26 
 
 		 475 aa  211  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  31.48 
 
 		 475 aa  210  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  32.13 
 
 		 442 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  34.7 
 
 		 486 aa  206  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  31.17 
 
 		 480 aa  206  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  33.63 
 
 		 452 aa  206  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  33.63 
 
 		 452 aa  206  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  31.81 
 
 		 468 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  31.8 
 
 		 497 aa  205  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  30.21 
 
 		 468 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  34.69 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  32.51 
 
 		 486 aa  200  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  30.62 
 
 		 464 aa  199  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>