248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3185 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  74.57 
 
 		 471 aa  642    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 464 aa  911    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  74.28 
 
 		 463 aa  632  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  73.1 
 
 		 464 aa  622  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  66.74 
 
 		 507 aa  555  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  65.64 
 
 		 456 aa  535  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  63.96 
 
 		 518 aa  510  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  59.69 
 
 		 448 aa  461  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  61.45 
 
 		 455 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  52.15 
 
 		 467 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  53 
 
 		 467 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  52.41 
 
 		 467 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  53.29 
 
 		 475 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  52.62 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  45.84 
 
 		 538 aa  390  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  47.9 
 
 		 546 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 550 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  47.93 
 
 		 553 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  47.63 
 
 		 554 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  47.93 
 
 		 553 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  48.66 
 
 		 553 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  47.45 
 
 		 552 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  47.36 
 
 		 575 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  47.36 
 
 		 575 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  45.98 
 
 		 545 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  45.95 
 
 		 545 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 		 545 aa  375  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  47.54 
 
 		 552 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  47.15 
 
 		 549 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  47.19 
 
 		 552 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  45.53 
 
 		 548 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  45.9 
 
 		 545 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  46.5 
 
 		 547 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  46.8 
 
 		 553 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  46.2 
 
 		 551 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  46.39 
 
 		 552 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  46.9 
 
 		 553 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  46.69 
 
 		 553 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  46.08 
 
 		 549 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 537 aa  360  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  45.81 
 
 		 549 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  47.2 
 
 		 566 aa  359  5e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  44.78 
 
 		 558 aa  350  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 556 aa  342  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  46.42 
 
 		 556 aa  339  7e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  39.05 
 
 		 570 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 		 433 aa  283  6.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 418 aa  264  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 		 424 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 412 aa  253  7e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  38.97 
 
 		 424 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  37.44 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  37.17 
 
 		 424 aa  226  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  36.73 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  36.8 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 442 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 453 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0820  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  31.81 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  32.65 
 
 		 938 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 421 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 421 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 442 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 		 416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  31.03 
 
 		 438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  26.08 
 
 		 436 aa  113  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 391 aa  113  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32095  predicted protein  39.61 
 
 		 679 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  24.89 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 421 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 407 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 434 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  24.43 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  24.43 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  27.06 
 
 		 410 aa  103  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0904  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  24.94 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  24.94 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  24.94 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  24.94 
 
 		 402 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  24.68 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  25.34 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  24.94 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  24.68 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  25.26 
 
 		 402 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  24.68 
 
 		 400 aa  99  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  24.68 
 
 		 402 aa  99  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>