More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1456 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 235 aa  450  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  51.67 
 
 		 256 aa  234  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  53.33 
 
 		 256 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  53.33 
 
 		 256 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  53.33 
 
 		 256 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  49.79 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1629  short chain dehydrogenase  48.75 
 
 		 257 aa  211  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1573  short chain dehydrogenase  48.33 
 
 		 257 aa  210  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.5 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  48.31 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  44.17 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  44.17 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  44.17 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  44.77 
 
 		 251 aa  207  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.27 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4068  short chain dehydrogenase  48.75 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  48.32 
 
 		 254 aa  204  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  48.97 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  48.97 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0363  short chain dehydrogenase  48.97 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  48.97 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170009  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  48.97 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  48.97 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0458  short chain dehydrogenase  48.56 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.83 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  47.33 
 
 		 254 aa  198  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3231  short chain dehydrogenase  46.06 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3552  short chain dehydrogenase  45 
 
 		 241 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3788  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798977 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4815  short chain dehydrogenase  45 
 
 		 241 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5468  short chain dehydrogenase  45 
 
 		 241 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.107727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0339  short chain dehydrogenase  44.12 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 		 275 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4196  short chain dehydrogenase  44.17 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4719  short chain dehydrogenase  44.17 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.72 
 
 		 249 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2430  short chain dehydrogenase  46.31 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1926  short chain dehydrogenase  46.31 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00605891  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.31 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.08 
 
 		 250 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.3 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00521448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1913  short chain dehydrogenase  46.31 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1193  short chain dehydrogenase  46.31 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2074  short chain dehydrogenase  46.31 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0862  short chain dehydrogenase  46.31 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.140204  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1636  short chain dehydrogenase  46.31 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0299  short chain dehydrogenase  46.31 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71932  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.9 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0755029  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.34 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.93 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0889  short chain dehydrogenase  43.33 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122847  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 		 241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3615  putative dehydrogenase  38.93 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.427411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.08 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.96 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2097  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.87 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1819  glucose 1-dehydrogenase  40.57 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00010189  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 251 aa  151  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203044  normal  0.111569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1892  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.87 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.362841  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.65 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20330  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 		 249 aa  148  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2335  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.7 
 
 		 253 aa  148  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  38.59 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3604  putative dehydrogenase  44.14 
 
 		 281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04660  2-hydroxycyclohexane-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  42.32 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 254 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0505  short chain dehydrogenase  42.62 
 
 		 246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.43 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 		 250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.805502  normal  0.135775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.96 
 
 		 247 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000457862  decreased coverage  0.00144514 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5343  carbonyl reductase  38.49 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 		 251 aa  144  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.379199  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>