More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0509 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0509  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 275 aa  523  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.391002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 		 502 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7352  Alpha/beta hydrolase  37.68 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4494  alpha/beta family hydrolase  38.65 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 		 275 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  37.14 
 
 		 260 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  34.41 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 		 252 aa  99.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  28.9 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 		 265 aa  96.3  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  28.19 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1114  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0902731  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  29.28 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.59 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  29.13 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.86 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 277 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  27.3 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 269 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 308 aa  62  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  26.05 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  26.64 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  25.18 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  35.11 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5231  alpha/beta hydrolase fold protein  28.33 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2198  alpha/beta hydrolase fold  20.4 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00385806  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  40.17 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6262  alpha/beta hydrolase  25.4 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  30.08 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 346 aa  57  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  25.29 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  28.23 
 
 		 393 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  40.51 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  23.93 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  30.94 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  25.67 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  27.41 
 
 		 397 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 387 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  40.38 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  32.72 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  27.64 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  29.01 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  39.24 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.8 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.45 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.41 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 363 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  21.94 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0128  Chloride peroxidase  37.6 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00372982  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>