More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1418 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  62.13 
 
 		 1199 aa  1446    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  62.28 
 
 		 1169 aa  1487    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  37.68 
 
 		 1132 aa  741    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.7 
 
 		 1132 aa  744    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  45.72 
 
 		 1212 aa  1019    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  65.76 
 
 		 1157 aa  1580    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.21 
 
 		 1132 aa  741    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.21 
 
 		 1133 aa  741    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.21 
 
 		 1133 aa  743    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  37.64 
 
 		 1132 aa  736    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  64.91 
 
 		 1158 aa  1524    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  43.97 
 
 		 1182 aa  996    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  61.59 
 
 		 1192 aa  1482    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  40.02 
 
 		 1196 aa  805    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  77.65 
 
 		 1176 aa  1860    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  46.96 
 
 		 1178 aa  1043    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  43.48 
 
 		 1188 aa  972    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  63.64 
 
 		 1195 aa  1471    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  70.49 
 
 		 1214 aa  1672    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  39.85 
 
 		 1208 aa  810    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  41.72 
 
 		 1187 aa  957    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  62.72 
 
 		 1167 aa  1460    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  63.46 
 
 		 1154 aa  1508    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  45.65 
 
 		 1208 aa  1006    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  43.12 
 
 		 1191 aa  984    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  46.47 
 
 		 1208 aa  1029    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  73.69 
 
 		 1193 aa  1727    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  45.07 
 
 		 1214 aa  1000    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.21 
 
 		 1132 aa  741    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  40.87 
 
 		 1163 aa  876    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  43.02 
 
 		 1188 aa  981    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  46.87 
 
 		 1190 aa  1029    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  48.15 
 
 		 1182 aa  1014    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  42.04 
 
 		 1149 aa  772    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  42.05 
 
 		 1150 aa  805    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  39.33 
 
 		 1169 aa  783    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  45.81 
 
 		 1191 aa  1037    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  45.64 
 
 		 1191 aa  1035    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  100 
 
 		 1181 aa  2423    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  40.99 
 
 		 1189 aa  811    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.21 
 
 		 1132 aa  756    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  45.78 
 
 		 1176 aa  1031    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  39.82 
 
 		 1180 aa  815    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  62.61 
 
 		 1156 aa  1491    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  46.6 
 
 		 1223 aa  1038    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  46.66 
 
 		 1215 aa  1021    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  39.1 
 
 		 1254 aa  794    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  42.95 
 
 		 1188 aa  972    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  62.54 
 
 		 1154 aa  1514    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.7 
 
 		 1132 aa  743    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  43.8 
 
 		 1182 aa  996    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  47.5 
 
 		 1171 aa  1020    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  45.54 
 
 		 1197 aa  1012    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  44.73 
 
 		 1224 aa  1023    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  37.76 
 
 		 1132 aa  740    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  46.63 
 
 		 1183 aa  1071    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  38.75 
 
 		 1136 aa  747    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  62.64 
 
 		 1171 aa  1458    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  39.59 
 
 		 1136 aa  754    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  69.21 
 
 		 1216 aa  1640    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  62.26 
 
 		 1178 aa  1472    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  60.39 
 
 		 1184 aa  1437    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  42.32 
 
 		 1150 aa  788    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.21 
 
 		 1132 aa  741    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  61.43 
 
 		 1158 aa  1444    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  41.15 
 
 		 1156 aa  885    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  52.12 
 
 		 1151 aa  1120    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  42.18 
 
 		 1150 aa  785    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  61.52 
 
 		 1173 aa  1449    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  47.97 
 
 		 1168 aa  1010    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  32.79 
 
 		 1266 aa  602  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  33.36 
 
 		 1237 aa  590  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  32.88 
 
 		 1245 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  32.74 
 
 		 1239 aa  572  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  32.83 
 
 		 1262 aa  572  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  33.47 
 
 		 1232 aa  570  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  31.57 
 
 		 1238 aa  567  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2911  B12-dependent methionine synthase  32.74 
 
 		 1257 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  32.53 
 
 		 1271 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  33.98 
 
 		 1236 aa  561  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  32.34 
 
 		 1267 aa  560  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  33.04 
 
 		 1250 aa  560  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  32.53 
 
 		 1257 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  32.47 
 
 		 1227 aa  558  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  32.82 
 
 		 1245 aa  559  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  31.21 
 
 		 1226 aa  556  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  31.45 
 
 		 1246 aa  558  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  31.64 
 
 		 1241 aa  555  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  33.01 
 
 		 1278 aa  555  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  32.52 
 
 		 1251 aa  554  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2966  B12-dependent methionine synthase  31.9 
 
 		 1257 aa  552  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  32.36 
 
 		 1237 aa  551  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  31.7 
 
 		 1232 aa  551  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  32.28 
 
 		 1236 aa  552  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  33.86 
 
 		 1226 aa  552  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  32.48 
 
 		 1264 aa  550  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  30.93 
 
 		 1274 aa  552  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1638  B12-dependent methionine synthase  31.96 
 
 		 1250 aa  547  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  31.98 
 
 		 1227 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  32 
 
 		 1233 aa  548  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>