More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0204 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0204  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
385 aa  788    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1224  coproporphyrinogen III oxidase  65.79 
 
 
385 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2661  coproporphyrinogen III oxidase  64.74 
 
 
385 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2885  coproporphyrinogen III oxidase  65.26 
 
 
385 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3460  coproporphyrinogen III oxidase  64.14 
 
 
387 aa  509  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0013  coproporphyrinogen III oxidase  63.71 
 
 
394 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2870  coproporphyrinogen III oxidase  61.68 
 
 
384 aa  494  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0605644  normal  0.195461 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0471  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  59.15 
 
 
392 aa  434  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039333  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0436  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  59.15 
 
 
398 aa  431  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  0.414795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0403  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  59.42 
 
 
405 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68433  normal  0.919308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0024  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  56.99 
 
 
398 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0191  coproporphyrinogen III oxidase  54.86 
 
 
386 aa  412  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2155  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  53.59 
 
 
389 aa  413  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0184  coproporphyrinogen III oxidase  54.23 
 
 
385 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0027  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  57.52 
 
 
387 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444781  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0149  coproporphyrinogen III oxidase  53.49 
 
 
386 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0323  coproporphyrinogen III oxidase  52.65 
 
 
386 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2941  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  56.99 
 
 
391 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0394  coproporphyrinogen III oxidase  53.32 
 
 
393 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0423  coproporphyrinogen III oxidase  52.91 
 
 
390 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3398  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  53.44 
 
 
402 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4013  coproporphyrinogen III oxidase  54.91 
 
 
387 aa  398  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00338322  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1337  coproporphyrinogen III oxidase  51.16 
 
 
392 aa  395  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0397  coproporphyrinogen III oxidase  52.38 
 
 
385 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0330  coproporphyrinogen III oxidase  52.65 
 
 
385 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0003  coproporphyrinogen III oxidase  52.79 
 
 
400 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.242877  hitchhiker  0.00414143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0003  coproporphyrinogen III oxidase  53.32 
 
 
401 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.045882 
 
 
-
 
NC_004310  BR0176  coproporphyrinogen III oxidase  52.45 
 
 
385 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0170  coproporphyrinogen III oxidase  52.45 
 
 
404 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.379163  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0185  coproporphyrinogen III oxidase  52.38 
 
 
409 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0007  coproporphyrinogen III oxidase  51.99 
 
 
381 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.51 
 
 
385 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0569  coproporphyrinogen III oxidase  52.23 
 
 
397 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2537  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  53.72 
 
 
399 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1693  coproporphyrinogen III oxidase  51.98 
 
 
382 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616989  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3639  coproporphyrinogen III oxidase  54.41 
 
 
414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  50.39 
 
 
384 aa  356  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  50.91 
 
 
393 aa  351  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0258  coproporphyrinogen III oxidase  50.92 
 
 
381 aa  344  2e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0173  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.31 
 
 
387 aa  290  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0789  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.284669  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.86 
 
 
392 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3011  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.31 
 
 
389 aa  271  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.32 
 
 
387 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  39.42 
 
 
399 aa  267  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0528  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.32 
 
 
382 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4026  coproporphyrinogen III oxidase  39.31 
 
 
407 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.799175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 
413 aa  260  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  37.57 
 
 
419 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0665  coproporphyrinogen III oxidase  38.5 
 
 
404 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0912478  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0040  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  38.86 
 
 
384 aa  255  7e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  38.68 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.83 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.958254  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2346  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  38.83 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.2 
 
 
382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0516  coproporphyrinogen III oxidase  36.75 
 
 
404 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0955  coproporphyrinogen III oxidase  36.75 
 
 
404 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337282  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0995  coproporphyrinogen III oxidase  36.75 
 
 
404 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.99 
 
 
394 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  38.2 
 
 
401 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4103  coproporphyrinogen III oxidase  36.22 
 
 
404 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274585  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  37.08 
 
 
422 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  36.9 
 
 
409 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  36.22 
 
 
404 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  36.91 
 
 
405 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  36.22 
 
 
404 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  38.95 
 
 
408 aa  246  6e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3053  coproporphyrinogen III oxidase  36.65 
 
 
405 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3019  coproporphyrinogen III oxidase  36.65 
 
 
405 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  36.22 
 
 
404 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  36.63 
 
 
409 aa  245  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5151  coproporphyrinogen III oxidase  38.06 
 
 
391 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.294445  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1968  coproporphyrinogen III oxidase  36.65 
 
 
405 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137157  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2100  coproporphyrinogen III oxidase  36.65 
 
 
405 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0811  coproporphyrinogen III oxidase  36.65 
 
 
405 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2644  coproporphyrinogen III oxidase  36.65 
 
 
405 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0479  coproporphyrinogen III oxidase  39.2 
 
 
392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4159  coproporphyrinogen III oxidase  38.95 
 
 
386 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2703  putative anaerobic coproporphyrinogen III oxidase oxidoreductase protein  37.34 
 
 
417 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1582  coproporphyrinogen III oxidase  36.39 
 
 
405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05040  coproporphyrinogen III oxidase  38.7 
 
 
384 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5101  coproporphyrinogen III oxidase  38.16 
 
 
391 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608313  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0770  coproporphyrinogen III oxidase  38.28 
 
 
378 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.261122  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  38.24 
 
 
384 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0364  coproporphyrinogen III oxidase  37.86 
 
 
395 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250524  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0759  coproporphyrinogen III oxidase  37.27 
 
 
378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573813 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0068  coproporphyrinogen III oxidase  35.84 
 
 
408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3115  coproporphyrinogen III oxidase  37.27 
 
 
378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.8 
 
 
416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3387  coproporphyrinogen III oxidase  37.27 
 
 
378 aa  240  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4035  coproporphyrinogen III oxidase  37.86 
 
 
379 aa  239  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3097  coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 
378 aa  239  8e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000345052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4258  coproporphyrinogen III oxidase  37.01 
 
 
378 aa  238  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0740  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.01 
 
 
378 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02785  coproporphyrinogen III oxidase  36.91 
 
 
378 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.179359  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02748  hypothetical protein  36.91 
 
 
378 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1631  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.44 
 
 
394 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3612  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 
379 aa  237  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02372  coproporphyrinogen III oxidase  38.86 
 
 
385 aa  236  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0471  coproporphyrinogen III oxidase  38.89 
 
 
404 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.804831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>