67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1829 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  98.86 
 
 		 788 aa  1543    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  99.11 
 
 		 788 aa  1546    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  100 
 
 		 788 aa  1559    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  46.2 
 
 		 794 aa  608  1e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  40.05 
 
 		 786 aa  495  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  40.48 
 
 		 783 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  40.05 
 
 		 781 aa  472  1.0000000000000001e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  37.23 
 
 		 803 aa  445  1e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  33.85 
 
 		 780 aa  353  8e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  30.79 
 
 		 781 aa  310  6.999999999999999e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  25.48 
 
 		 1047 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  25 
 
 		 1047 aa  88.2  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  24.08 
 
 		 1045 aa  85.5  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  23.99 
 
 		 984 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  25.51 
 
 		 988 aa  77.8  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  25.39 
 
 		 951 aa  77.4  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  21.55 
 
 		 1037 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  23.26 
 
 		 1054 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  25.41 
 
 		 1059 aa  70.1  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  24.69 
 
 		 1047 aa  70.9  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  24.44 
 
 		 911 aa  68.2  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1100 aa  66.6  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1039 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  21.32 
 
 		 1000 aa  65.1  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  21.47 
 
 		 962 aa  64.7  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  22.32 
 
 		 1040 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1048 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  21.47 
 
 		 947 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  24.1 
 
 		 977 aa  62.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22 
 
 		 1042 aa  62  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  21.77 
 
 		 997 aa  62  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  24.71 
 
 		 919 aa  61.6  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  20.54 
 
 		 976 aa  59.3  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.97 
 
 		 958 aa  58.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  20.68 
 
 		 993 aa  58.2  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  21.73 
 
 		 991 aa  56.2  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  23.37 
 
 		 1015 aa  56.6  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  28.11 
 
 		 267 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  26.97 
 
 		 277 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1042 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  26.97 
 
 		 277 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  26.97 
 
 		 277 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  26.15 
 
 		 1001 aa  52  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  22.09 
 
 		 951 aa  52.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1052 aa  52  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  24.6 
 
 		 968 aa  51.2  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  24.88 
 
 		 302 aa  50.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  23.05 
 
 		 1052 aa  50.1  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  26.44 
 
 		 909 aa  49.3  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  26.06 
 
 		 273 aa  48.9  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  26.89 
 
 		 379 aa  48.9  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  24.19 
 
 		 291 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  23.91 
 
 		 311 aa  48.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  24.75 
 
 		 304 aa  48.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  22.85 
 
 		 969 aa  47.8  0.0009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  22.85 
 
 		 969 aa  47.8  0.0009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  20.17 
 
 		 836 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  26.52 
 
 		 278 aa  47.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  32.8 
 
 		 379 aa  47.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  21.85 
 
 		 858 aa  46.6  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  21.85 
 
 		 858 aa  45.8  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  22.77 
 
 		 280 aa  45.8  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  24.86 
 
 		 295 aa  45.8  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  20.73 
 
 		 960 aa  45.8  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  21.74 
 
 		 922 aa  46.2  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  24.18 
 
 		 298 aa  44.7  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  24.31 
 
 		 323 aa  44.3  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>