More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_17500 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  100 
 
 
239 aa  483  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  61.6 
 
 
245 aa  308  5e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  61.09 
 
 
243 aa  307  1.0000000000000001e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  60.92 
 
 
246 aa  306  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 
246 aa  305  3e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  61.51 
 
 
254 aa  303  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  60 
 
 
244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2741  ABC transporter related protein  64.02 
 
 
245 aa  302  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  61.09 
 
 
247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  61.37 
 
 
243 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  60.85 
 
 
246 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  60.92 
 
 
244 aa  301  7.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1236  ABC transporter related protein  59.13 
 
 
245 aa  301  9e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.839262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  61.09 
 
 
246 aa  300  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  60.08 
 
 
244 aa  300  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  58.58 
 
 
246 aa  296  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  59.24 
 
 
244 aa  297  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  58.65 
 
 
240 aa  296  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  58.58 
 
 
244 aa  295  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  60 
 
 
243 aa  295  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  59.24 
 
 
247 aa  294  7e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.32 
 
 
241 aa  294  8e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  58.16 
 
 
243 aa  294  8e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.58 
 
 
241 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59 
 
 
241 aa  293  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.58 
 
 
241 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.58 
 
 
241 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.58 
 
 
241 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.58 
 
 
241 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.58 
 
 
241 aa  292  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  60.59 
 
 
241 aa  291  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  56.72 
 
 
244 aa  291  4e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59 
 
 
241 aa  291  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  59.66 
 
 
277 aa  290  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.58 
 
 
241 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  58.58 
 
 
244 aa  290  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59 
 
 
241 aa  289  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59 
 
 
241 aa  289  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  58.82 
 
 
241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  57.68 
 
 
241 aa  288  7e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0868  ABC transporter related protein  58.4 
 
 
245 aa  288  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463879  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  59.57 
 
 
244 aa  287  9e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  58.47 
 
 
241 aa  287  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  58.58 
 
 
242 aa  287  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2070  ABC transporter related  57.98 
 
 
245 aa  287  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0552622  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  56.17 
 
 
249 aa  286  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  58.05 
 
 
241 aa  286  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3391  ABC transporter related  58.4 
 
 
245 aa  286  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  56.3 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  56.85 
 
 
241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  58.92 
 
 
249 aa  285  4e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  58.92 
 
 
249 aa  285  4e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  56.3 
 
 
258 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  58.05 
 
 
241 aa  285  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 
246 aa  284  8e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0828  ABC transporter related  55.65 
 
 
239 aa  284  8e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  56.96 
 
 
263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  56.07 
 
 
251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  56.6 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  58.05 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  61.34 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  57.08 
 
 
321 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  58.47 
 
 
241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03066  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  59.41 
 
 
241 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00157983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0506  ABC transporter related protein  59.41 
 
 
241 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3497  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.41 
 
 
241 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03017  hypothetical protein  59.41 
 
 
241 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00220423  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4523  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.41 
 
 
241 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3569  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.41 
 
 
241 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0499  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.41 
 
 
241 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406255  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3394  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.41 
 
 
241 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  57.32 
 
 
247 aa  281  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  56.96 
 
 
264 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3689  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59 
 
 
241 aa  280  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
243 aa  280  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  55.46 
 
 
270 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  57.38 
 
 
258 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  58.75 
 
 
243 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  58.75 
 
 
243 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0727  ABC transporter-related protein  60 
 
 
243 aa  279  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  56.3 
 
 
244 aa  280  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0973  ABC transporter related  58.12 
 
 
240 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.156124  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  58.75 
 
 
243 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  58.75 
 
 
241 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  58.75 
 
 
243 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  57.38 
 
 
258 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  58.75 
 
 
243 aa  279  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  58.75 
 
 
243 aa  279  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  57.38 
 
 
258 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  58.75 
 
 
243 aa  279  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.62 
 
 
268 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  57.87 
 
 
250 aa  279  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  57.38 
 
 
258 aa  278  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  58.75 
 
 
243 aa  278  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  56.97 
 
 
258 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  55.06 
 
 
264 aa  277  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  56.97 
 
 
258 aa  278  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  57.26 
 
 
241 aa  278  8e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  57.02 
 
 
268 aa  277  9e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  56.97 
 
 
258 aa  277  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>